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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003877`

染色体: Chr08 坐标: 45959820-45960712 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003877`
名称	SmilChr08G003877
描述	uncharacterized SmilChr08G003877
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	45959820 - 45960712 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998546`
GeneID	`130998546`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998546`
原始查询	`SmilChr08G003877`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0191000; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os04g0191000; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os04g0191000` - identity=25.6; qcov=0.977; evalue=7.02e-14; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0015074 (DNA integration)
KEGG	-
Pfam	PF00665 (rve); PF31073 (DUF8803)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998546

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057779944.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057779944.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.60000	`XP_057779944.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779944.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779944.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:45959894`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B118,C8,D7
`Chr8:45959894`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B118,C8,D7
`Chr8:45959950`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B139,B69,B8
`Chr8:45959982`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C11,C51,C63,C69
`Chr8:45960014`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr8:45960025`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B26
`Chr8:45960025`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B26
`Chr8:45960027`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr8:45960047`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr8:45960074`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,B11,B139,C57
`Chr8:45960166`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C11,C51,C63,C69
`Chr8:45960169`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779944.1

260 aa

130

260

rve

DUF8803

PF00665 rve 8-105 aa PF31073 DUF8803 229-259 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779944.1`	Pfam	`PF00665`	rve	Domain	8	105	1.3e-19	71.0	Integrase core domain
`XP_057779944.1`	Pfam	`PF31073`	DUF8803	Domain	229	259	3e-08	34.1	Domain of unknown function (DUF8803)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923961.1
ATGGGCGTTATGTACGCTGCATGTCCATTCGACAAGTGGGGTATCGACATAGTCGGGAAGCTGCCCACGGCACCAGGGGGCAAATGCTTTCTGCTTGTAGCGGTGGACTACTTCTCTAAGTGGGTCGAGGCTGAGGTTGTGGGGAAAATCGATGAGGTGACTGTGGAGCGCTTCATTTGGCGGAATATATGTTGCAGATTTGGGGTCCCAAGGATCATCGTTTCTGACAACGGAACCCAGTTTACAGGGCAGAGGATCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998546
ATGGGCGTTATGTACGCTGCATGTCCATTCGACAAGTGGGGTATCGACATAGTCGGGAAGCTGCCCACGGCACCAGGGGGCAAATGCTTTCTGCTTGTAGCGGTGGACTACTTCTCTAAGTGGGTCGAGGCTGAGGTTGTGGGGAAAATCGATGAGGTGACTGTGGAGCGCTTCATTTGGCGGAATATATGTTGCAGATTTGGGGTCCCAAGGATCATCGTTTCTGACAACGGAACCCAGTTTACAGGGCAGAGGATCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779944.1
MGVMYAACPFDKWGIDIVGKLPTAPGGKCFLLVAVDYFSKWVEAEVVGKIDEVTVERFIWRNICCRFGVPRIIVSDNGTQFTGQRIADFCDRMDITQRFVSVAHPQANGQVELANRTICEGIKKRLTQSKGKWVEELDTVLWAYSTSPKTATGEAPFTLVYGSNAVIPAEARLESYRITTYDTEHNAELRRAELDLVEAQRDEARVRAAKYKGIIKAGYDKQVRARKLSKGDLVLKRADALKAVGKFKANWEGPFIITED

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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