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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003902`

染色体: Chr08 坐标: 46307107-46307947 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003902`
名称	SmilChr08G003902
描述	NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit J, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	46307107 - 46307947 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998552`
GeneID	`130998552`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998552`
原始查询	`SmilChr08G003902`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit J, chloroplastic
产物	NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit J%2C chloroplastic
Arabidopsis	`ATCG00420` (ndhJ) NADH dehydrogenase subunit J [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844763] identity=89.8; qcov=0.902; evalue=1.52e-106; confidence=high
Rice	`Os12g0422971` - identity=41.7; qcov=0.345; evalue=3.74e-06; confidence=low
GO	GO:0008137 (NADH dehydrogenase (ubiquinone) activity)
KEGG	smil00190 (Oxidative phosphorylation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00329 (Complex1_30kDa)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998552

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057779951.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057779951.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057779951.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779951.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779951.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:46307514`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B133,C59,C84
`Chr8:46307738`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr8:46307829`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:46307943`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779951.1

174 aa

174

Complex1_30kDa

PF00329 Complex1_30kDa 36-153 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779951.1`	Pfam	`PF00329`	Complex1_30kDa	Domain	36	153	2.8e-34	119.0	Respiratory-chain NADH dehydrogenase, 30 Kd subunit

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923968.1
AACTTCGTAAGAAAATATCTCGAGAAATCTATGAAAATAGAATTGGCTCTCAACAAGCAAATCGGTGTTTTACGACCAATCACAAGTTTCATGTTGGACGCAATATTCATACTGGAAATTATGATCAAAAATTCCTCTATCAACCGGTACCTACTTCAGAAATCCCTACTGAAAACTTTTTCAAATATAAAAGTTCAGGATCTTCTCAGGAATTTGTGAATTAGGCAGGACTCCTTGTTGTACAGAATAACAAGCAGCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998552
ATGTGGGAGATAAAAAAGATGCAGGGTCGTTTATCTGCTTGGCTAGTCAAGCACGCGATAATTCATAGATCTTTGGGCTTTGATTATCAAGGAATAGAGACTTTACAAATAAAGCCCGAGGATTGGCATTCTATTGCCGTCATTTTATACGTATATGGTTACAATTATCTACGCTCCCAATGTGCCTATGATGTAGCACCTGGTGGACTGTTAGCTAGTGTGTATCATCTTACCAGAATAGAGTATGGTGTGGATCAACC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779951.1
MWEIKKMQGRLSAWLVKHAIIHRSLGFDYQGIETLQIKPEDWHSIAVILYVYGYNYLRSQCAYDVAPGGLLASVYHLTRIEYGVDQPEEVCIKVFASRRNPRIPSVFWVWKSVDFQERESYDMLGISYDNHPRLKRILMPESWIGWPLRKDYISPNFYEIQDALVIILLYQLQS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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