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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003916`

染色体: Chr08 坐标: 46643745-46644150 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003916`
名称	SmilChr08G003916
描述	40S ribosomal protein S15-3-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	46643745 - 46644150 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996837`
GeneID	`130996837`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996837`
原始查询	`SmilChr08G003916`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	40S ribosomal protein S15-3-like
产物	40S ribosomal protein S15-3-like
Arabidopsis	`AT5G09500` (AT5G09500) Ribosomal protein S19 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830809] identity=83.7; qcov=1; evalue=4.62e-51; confidence=high
Rice	`Os03g0798600` (OSJNBa0094F01.1) - identity=82.6; qcov=1; evalue=3.79e-50; confidence=medium
GO	GO:0000028 (ribosomal small subunit assembly); GO:0003723 (RNA binding); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0022627 (cytosolic small ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00203 (Ribosomal_S19)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996837

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057778089.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.40000	`XP_057778089.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778089.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778089.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778089.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:46643987`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B29,C11,C39,C41,C79
`Chr8:46644007`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr8:46644038`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr8:46644050`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B2,B30,B55,B68,B8
`Chr8:46644106`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr8:46644111`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B115,C2,C80
`Chr8:46644144`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778089.1

92 aa

Ribosomal_S19

PF00203 Ribosomal_S19 2-75 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778089.1`	Pfam	`PF00203`	Ribosomal_S19	Domain	2	75	4.2e-26	91.3	Ribosomal protein S19

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922106.1
GAAGCTCACACTAGCACACACCTTCACGCTGTAGTTCAGCTATCTCCACCGGCAACCATAGCGGACGTCGACCCCGAGGTAGCGGCTGGGCAGCCGAAGAAGAGAACATTCAAGAAGTTCAGCTTCCATGGCCTTGATCAAGAAGTTGCACAAGGCTAAGTGTGAAGCCCCAGCAAGTGAGAAGCCCGCCCTAGTTCGAACCCACTTGAGGAACATGATCATTGTCCCTGAGATGATAAGAAGTGTTCTCGGTGTGTATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996837
ATGGCCTTGATCAAGAAGTTGCACAAGGCTAAGTGTGAAGCCCCAGCAAGTGAGAAGCCCGCCCTAGTTCGAACCCACTTGAGGAACATGATCATTGTCCCTGAGATGATAAGAAGTGTTCTCGGTGTGTATAGCGGGAAGACCTTCAACCTTGTTGAAATTAAGCCCGAGATGATTGGGCATTACCTTGCTGAGTTCTCTATCTCATGCAAACTAATCGAGCACGGTAGGCCTGTTATCGGTGCCACCCACTCCTCCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778089.1
MALIKKLHKAKCEAPASEKPALVRTHLRNMIIVPEMIRSVLGVYSGKTFNLVEIKPEMIGHYLAEFSISCKLIEHGRPVIGATHSSRFIPLK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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