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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003925`

染色体: Chr08 坐标: 46732188-46733805 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003925`
名称	SmilChr08G003925
描述	uncharacterized SmilChr08G003925
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	46732188 - 46733805 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996840`
GeneID	`130996840`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996840`
原始查询	`SmilChr08G003925`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14223 (Retrotran_gag_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996840

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057778091.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057778091.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778091.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778091.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057778091.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:46733119`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr8:46733147`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B21
`Chr8:46733147`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21
`Chr8:46733217`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B103,B134,B71,D3
`Chr8:46733219`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B20,B6,B98,C23,C41
`Chr8:46733232`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B20,D4
`Chr8:46733234`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21
`Chr8:46733258`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	A11,A3,B22,B28,B57,B79,C48,C55,C59,C7,C76,D6
`Chr8:46733259`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B126,C25,C73
`Chr8:46733268`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B42,D11
`Chr8:46733283`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,C3
`Chr8:46733307`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B32,B34,B76,B88,B95

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778091.1

183 aa

183

Retrotran_gag_2

PF14223 Retrotran_gag_2 65-169 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778091.1`	Pfam	`PF14223`	Retrotran_gag_2	Domain	65	169	1.4e-12	48.4	gag-polypeptide of LTR copia-type

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922108.1
TGTTCGCAAGAACACTCTGTTTCTGATTAGGTTCTAATTGAACTAGATCCTTTTTCTCAAAGGTCTCGAAAACGTTTTCTCATCCAAATTGTGCTTGCTAATTGCTCTATATGTTGTTATCTGTTCTCTCTTTTTGATGGAGACTAACCATAGCAGATTATCTTCTCTACCTATGTTTAGTATTGAAAAATACGACATATGGAAGTTTCGGCTTGAAAGCTTCCTCACCGCCCAACATTGCCGAATGTGGGAAGTCATCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996840
ATGGAGACTAACCATAGCAGATTATCTTCTCTACCTATGTTTAGTATTGAAAAATACGACATATGGAAGTTTCGGCTTGAAAGCTTCCTCACCGCCCAACATTGCCGAATGTGGGAAGTCATCACCAACGGACCAATCACCATCACCGAAACCGTCAAAAGGGTTCCTGTTGATCCACATCAGGATCCTTACGATGAGGTCCAGCCCAAGCAAAAGGCAGACTTCTCCACAGAAGAAAGGAAGCAAGATGAGCTAGACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778091.1
METNHSRLSSLPMFSIEKYDIWKFRLESFLTAQHCRMWEVITNGPITITETVKRVPVDPHQDPYDEVQPKQKADFSTEERKQDELDNLAKSIISGTVPDKHVMKIIKCGTAKEMWDILERMCVGSEEIKENKLSIACQKFDSFLMLKNESVKEMELRFNQILNKVQSISKDKYTQREINLKIH

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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