当前解析结果
SmilChr08G003937| 统一新 Gene ID | SmilChr08G003937 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G003937 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G003937 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 47111718 - 47113597 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130996854 |
|---|---|
| GeneID | 130996854 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130996854 |
| 原始查询 | SmilChr08G003937 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130996854 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057778102.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057778102.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057778102.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057778102.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057778102.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:47112156 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B78 |
Chr8:47112173 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B35 |
Chr8:47112220 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B41,B44 |
Chr8:47112386 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B2 |
Chr8:47112443 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A6,B104,B41,B88,C20 |
Chr8:47112453 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A18 |
Chr8:47112478 |
T |
TTG |
2bp_insertion | frameshift_variant | 10 | A25,B123,B14,B75,B81,B99,C15,C26,C37,C74 |
Chr8:47112482 |
G |
GT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 33 | A10,A15,A19,A24,A25,A3,A5,B103,B107,B121,B132,B139,B14,B27,B58,B65,B66,B70,B80,B84,B93,C18,C2,C21,C3,C34,C39,C40,C58,C60,C75,C83,D10 |
Chr8:47113150 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 3 | B127,C13,C52 |
Chr8:47113150 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B127,C13,C52 |
Chr8:47113151 |
TA |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 31 | A16,A18,A20,A5,B115,B127,B133,B18,B4,B49,B51,B58,B59,B62,B70,B79,B91,B92,B99,C22,C24,C27,C32,C41,C42,C62,C69,C76,C86,D2,D3 |
Chr8:47113165 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 98 | A11,A19,A23,A25,A6,B102,B104,B105,B108,B111,B119,B12,B120,B121,B122,B123,B126,B127,B128,B13,B137,B14,B140,B15,B20,B21,B23,B27,B28,B30,B33,B34,B37,B38,B4,B41,B44,B45,B5,B53,B54,B57,B63,B66,B67,B68,B71,B73,B74,B75,B8,B81,B83,B85,B86,B89,B95,B99,C1,C14,C15,C16,C18,C19,C2,C20,C23,C26,C33,C34,C35,C37,C4,C41,C45,C46,C47,C5,C50,C53,C61,C62,C64,C68,C7,C74,C75,C76,C8,C80,C82,C84,D1,D11,D2,D5,D6,D7 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
4 records
下载 cDNA FASTA4 records
下载 CDS FASTA4 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。