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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003957`

染色体: Chr08 坐标: 47382072-47384962 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003957`
名称	SmilChr08G003957
描述	uncharacterized SmilChr08G003957
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	47382072 - 47384962 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996887`
GeneID	`130996887`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996887`
原始查询	`SmilChr08G003957`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cleavage and polyadenylation specificity factor 160 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835240]; symbol=CPSF160; hit=AT5G51660; species=arabidopsis; confidence=low
产物	cleavage and polyadenylation specificity factor 160 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835240]; symbol=CPSF160; hit=AT5G51660; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G51660` (CPSF160) cleavage and polyadenylation specificity factor 160 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835240] identity=46.3; qcov=0.391; evalue=3.07e-10; confidence=low
Rice	`Os04g0252200` - identity=44.4; qcov=0.391; evalue=4.36e-06; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996887

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057778149.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057778149.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778149.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778149.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057778149.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:47383265`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	21	A1,B11,B118,B123,B20,B46,B5,B67,B74,B86,B95,B99,C10,C20,C46,C50,C58,C61,C68,C79,D5
`Chr8:47383279`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:47383292`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B4,B67,B75,C42,C46
`Chr8:47383307`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr8:47383314`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B122
`Chr8:47383314`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B122
`Chr8:47383318`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	108	A11,A16,A2,A20,A24,A5,A6,A7,B100,B101,B103,B105,B106,B107,B112,B113,B119,B12,B120,B121,B127,B13,B130,B133,B134,B135,B136,B137,B138,B139,B15,B16,B17,B18,B24,B26,B29,B31,B32,B33,B34,B37,B38,B39,B4,B40,B44,B45,B47,B5,B50,B52,B55,B56,B57,B62,B64,B67,B68,B75,B79,B85,B86,B88,B9,B90,B94,B96,C1,C10,C11,C12,C14,C15,C22,C24,C25,C3,C33,C34,C35,C38,C4,C40,C42,C46,C49,C51,C54,C56,C57,C60,C63,C64,C66,C69,C7,C70,C73,C74,C77,C8,C83,C85,C86,C9,D1,D2
`Chr8:47383329`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr8:47383330`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr8:47383351`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	14	B100,B102,B11,B20,B45,B64,B81,C24,C25,C26,C34,C44,C63,C67
`Chr8:47383677`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B106,B66,C79,C80,D5
`Chr8:47383678`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

7 records

下载 cDNA FASTA

XR_009092861.1
TACACCCTAGCCAACCCACTCTTTCTCTCACCGTTCTCTCTCTTCCACCGCCTTACTCCCTTCATCACCGCCATTCTCCACCGTCCTCGCCGCCGCATAGCTGTTCGCGCCGCCGTCCTCTCCGCTGAGGCCCTCTATCCATTTCTCTTCCGCGAACAGCAGCGGTCCGAGCCGCCGCCGCCGCTGATGTATCCTTCTCTGAAACTCCGGCGTCGCTTCTGTAAAATCTGGCGACTGATTTTCACCGTTCTTTCCCTCTT...

XR_009092860.1
TACACCCTAGCCAACCCACTCTTTCTCTCACCGTTCTCTCTCTTCCACCGCCTTACTCCCTTCATCACCGCCATTCTCCACCGTCCTCGCCGCCGCATAGCTGTTCGCGCCGCCGTCCTCTCCGCTGAGGCCCTCTATCCATTTCTCTTCCGCGAACAGCAGCGGTCCGAGCCGCCGCCGCCGCTGATGTATCCTTCTCTGAAACTCCGGCGTCGCTTCTGTAAAATCTGGCGACTGATTTTCACCGTTCTTTCCCTCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996887
ATGGGATGTCGAGGATGTCAAAGAAGAAGAAGAGGAATAAAGCTTGTGTCTAATAGTTTGGTTTTAGAAGCTGCCGCCGCGCCAGATCGTGCCTTAGCCAAAAAATACCAGAGAGAGGACCCAACTACTCGTCGTATTTGTATTTGCAAGAATGCTAGCTCTGGATTAGCTGCACCTGCGGAGGACAGTACTTTCAGGGCAGCTGGTGCATCCCGAATTGAATCGTCGTATATTGTTGGCTTACGAGATCTTGATATGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778149.1
MGCRGCQRRRRGIKLVSNSLVLEAAAAPDRALAKKYQREDPTTRRICICKNASSGLAAPAEDSTFRAAGASRIESSYIVGLRDLDMKHVKDFIFIHISHMWMTLKFSSTSSWRIKLMGVDALFFNRECSQKLSYEDYY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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