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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003961`

染色体: Chr08 坐标: 47524897-47526980 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003961`
名称	SmilChr08G003961
描述	protein-S-isoprenylcysteine O-methyltransferase A-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	47524897 - 47526980 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996875`
GeneID	`130996875`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996875`
原始查询	`SmilChr08G003961`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein-S-isoprenylcysteine O-methyltransferase A-like
产物	protein-S-isoprenylcysteine O-methyltransferase A-like
Arabidopsis	`AT5G08335` (ATSTE14B) Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase (ICMT) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830731] identity=64.8; qcov=0.883; evalue=8.96e-93; confidence=high
Rice	`Os04g0602900` - identity=53.7; qcov=0.302; evalue=1.32e-22; confidence=low
GO	GO:0004671 (protein C-terminal S-isoprenylcysteine carboxyl O-methyltransferase activity); GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0006481 (C-terminal protein methylation); GO:0016020 (membrane)
KEGG	smil00900 (Terpenoid backbone biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04140 (ICMT); PF04191 (PEMT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996875

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057778135.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057778135.1`
3	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057778135.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778136.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778136.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:47525024`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C87
`Chr8:47525024`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C87
`Chr8:47525047`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	62	A1,B102,B103,B11,B117,B118,B119,B120,B121,B13,B130,B131,B15,B20,B27,B28,B29,B30,B37,B49,B6,B60,B64,B69,B75,B77,B78,B81,B87,B9,B90,B92,B98,C11,C12,C15,C19,C22,C24,C26,C38,C4,C41,C42,C44,C45,C50,C51,C55,C6,C63,C65,C69,C7,C75,C78,C81,C83,C9,D1,D10,D5
`Chr8:47526103`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr8:47526329`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C85
`Chr8:47526329`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C85
`Chr8:47526356`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr8:47526382`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C7
`Chr8:47526530`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B111,B79,C43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778135.1

268 aa

134

268

PEMT

ICMT

PF04191 PEMT 152-251 aa PF04140 ICMT 154-245 aa

XP_057778136.1

222 aa

111

222

PEMT

ICMT

PF04191 PEMT 106-205 aa PF04140 ICMT 108-199 aa

XP_057778137.1

222 aa

111

222

PEMT

ICMT

PF04191 PEMT 106-205 aa PF04140 ICMT 108-199 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778135.1`	Pfam	`PF04191`	PEMT	Family	152	251	1.2e-11	45.7	Phospholipid methyltransferase
`XP_057778135.1`	Pfam	`PF04140`	ICMT	Family	154	245	2.9e-29	102.1	Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase (ICMT) family
`XP_057778136.1`	Pfam	`PF04191`	PEMT	Family	106	205	7.5e-12	46.3	Phospholipid methyltransferase
`XP_057778136.1`	Pfam	`PF04140`	ICMT	Family	108	199	5.6e-29	101.1	Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase (ICMT) family
`XP_057778137.1`	Pfam	`PF04191`	PEMT	Family	106	205	7.5e-12	46.3	Phospholipid methyltransferase
`XP_057778137.1`	Pfam	`PF04140`	ICMT	Family	108	199	5.6e-29	101.1	Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase (ICMT) family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922152.1
GTAAAATTTGCGTCACTCAGTGAAACTCTTTTTTCTTTCCTTGAAAATATGAGGAATGTCAAACCTTTATCATGGGAAATTAGGTGTTATACATAGAACCACCGTATTCGCCGCGGCAACAACCGTCTCCGCCTCGCTCGCGGTACCTTTTGTCCCTGCCGCCGCCGCGCCCATGGCTTCACCGACATCAGGGATGTCATTTATAATGCATTTTTTGAACGAAGTGGAGCCCCACATTTCATCACTAATATCTTGCTTCT...

XM_057922153.1
GAGGAATGTCAAACCTTTATCATGGGAAATTAGGTGTTATACATAGAACCACCGTATTCGCCGCGGCAACAACCGTCTCCGCCTCGCTCGCGGTACCTTTTGTCCCTGCCGCCGCCGCGCCCATGGCTTCACCGACATCAGATGTTATTCCAAGCTTGTGCTATGTTCAGGGATGTCATTTATAATGCATTTTTTGAACGAAGTGGAGCCCCACATTTCATCACTAATATCTTGCTTCTCTACAATCACTTCAGAGATCT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130996875
ATGTCAAACCTTTATCATGGGAAATTAGGTGTTATACATAGAACCACCGTATTCGCCGCGGCAACAACCGTCTCCGCCTCGCTCGCGGTACCTTTTGTCCCTGCCGCCGCCGCGCCCATGGCTTCACCGACATCAGGGATGTCATTTATAATGCATTTTTTGAACGAAGTGGAGCCCCACATTTCATCACTAATATCTTGCTTCTCTACAATCACTTCAGAGATCTTCAGCTTCACGGCATTCAGACAGTTATCACAAAT...

LOC130996875
ATGTCATTTATAATGCATTTTTTGAACGAAGTGGAGCCCCACATTTCATCACTAATATCTTGCTTCTCTACAATCACTTCAGAGATCTTCAGCTTCACGGCATTCAGACAGTTATCACAAATGTTCTTTGCAATATTCTTCTTTCATGGTTCTGAATATCTCCTAGCACTTTTCTTTCATGGGAAAAACAGTGTAACTCTTGAGTCTCTTTTAATCAGCAAAAGTTATGTTTTGGCCATGGTCGGCTCCCTGGTGGAGTA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057778135.1
MSNLYHGKLGVIHRTTVFAAATTVSASLAVPFVPAAAAPMASPTSGMSFIMHFLNEVEPHISSLISCFSTITSEIFSFTAFRQLSQMFFAIFFFHGSEYLLALFFHGKNSVTLESLLISKSYVLAMVGSLVEYLVEIYFFPEMKEHWLISNTGLALVVVGEILRKLSIITAGRSFTHLIRRSREEDHVLVTHGVYSYIRHPSYCGFFIWSVGTQIMLCNPLCTVGFTVVVWRFFQQRILYEEYFLRQIFGSHYVEYARLT...

XP_057778136.1
MSFIMHFLNEVEPHISSLISCFSTITSEIFSFTAFRQLSQMFFAIFFFHGSEYLLALFFHGKNSVTLESLLISKSYVLAMVGSLVEYLVEIYFFPEMKEHWLISNTGLALVVVGEILRKLSIITAGRSFTHLIRRSREEDHVLVTHGVYSYIRHPSYCGFFIWSVGTQIMLCNPLCTVGFTVVVWRFFQQRILYEEYFLRQIFGSHYVEYARLTASGIPFVK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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