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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003964`

染色体: Chr08 坐标: 47625978-47626337 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003964`
名称	SmilChr08G003964
描述	uncharacterized SmilChr08G003964
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	47625978 - 47626337 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998569`
GeneID	`130998569`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998569`
原始查询	`SmilChr08G003964`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14223 (Retrotran_gag_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998569

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057779969.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057779969.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057779969.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779969.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779969.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:47625995`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,B33,B91
`Chr8:47626010`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B20,B98,C61,C80
`Chr8:47626011`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr8:47626014`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B110,C67
`Chr8:47626021`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:47626025`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C2
`Chr8:47626039`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B122
`Chr8:47626053`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C18
`Chr8:47626053`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C18
`Chr8:47626058`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C18,C35
`Chr8:47626070`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B17,B69,B75,B9
`Chr8:47626070`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B17,B69,B75,B9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779969.1

119 aa

119

Retrotran_gag_2

PF14223 Retrotran_gag_2 32-117 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779969.1`	Pfam	`PF14223`	Retrotran_gag_2	Domain	32	117	5.7e-11	43.2	gag-polypeptide of LTR copia-type

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923986.1
ATGTGGAAAGTCATCACCAAAGGACCAATCGTCATCACAGAAGTGGTTAAGAAGATACCACTGGACACCACAAAAGACCCATATGATGAAGTCCAGATTAAACCAAATGTCGACGTCATCACAGAAGAAAGAAAGCAAGATGAGCAGGATAATCTTGCCAAGAGTATCATCTCCGGAATAGTCCCAGACAAACATGTCACAAAGATCATCAAATGCAAGACCGCAAATGAGATATGGGATACTCTTGAAAGAATGTGCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998569
ATGTGGAAAGTCATCACCAAAGGACCAATCGTCATCACAGAAGTGGTTAAGAAGATACCACTGGACACCACAAAAGACCCATATGATGAAGTCCAGATTAAACCAAATGTCGACGTCATCACAGAAGAAAGAAAGCAAGATGAGCAGGATAATCTTGCCAAGAGTATCATCTCCGGAATAGTCCCAGACAAACATGTCACAAAGATCATCAAATGCAAGACCGCAAATGAGATATGGGATACTCTTGAAAGAATGTGCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779969.1
MWKVITKGPIVITEVVKKIPLDTTKDPYDEVQIKPNVDVITEERKQDEQDNLAKSIISGIVPDKHVTKIIKCKTANEIWDTLERMCIGSEEIKENKLSIACQKFDTFLMLKNESVEEME

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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