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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003970`

染色体: Chr08 坐标: 47726840-47729145 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003970`
名称	SmilChr08G003970
描述	cytochrome b-c1 complex subunit 8-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	47726840 - 47729145 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996892`
GeneID	`130996892`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996892`
原始查询	`SmilChr08G003970`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cytochrome b-c1 complex subunit 8-like
产物	cytochrome b-c1 complex subunit 8-like
Arabidopsis	`AT3G10860` (AT3G10860) Cytochrome b-c1 complex, subunit 8 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820256] identity=70.8; qcov=1; evalue=1.62e-34; confidence=medium
Rice	`Os06g0175900` - identity=73.6; qcov=1; evalue=1.88e-37; confidence=medium
GO	GO:0005750 (GO:0005750); GO:0006122 (mitochondrial electron transport, ubiquinol to cytochrome c); GO:0070469 (GO:0070469)
KEGG	-
Pfam	PF02939 (UcrQ); PF10890 (Cyt_b-c1_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996892

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057778155.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057778155.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	1.00000	`XP_057778155.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778155.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778155.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:47728852`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr8:47728870`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B113,B45,C25,C34,C63,C67
`Chr8:47728887`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	26	B1,B10,B120,B139,B140,B16,B29,B3,B32,B34,B35,B36,B4,B46,B58,B69,B73,B91,B94,B99,C23,C36,C46,C73,C75,C84
`Chr8:47728897`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,C60
`Chr8:47728939`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778155.1

72 aa

Cyt_b-c1_8

UcrQ

PF10890 Cyt_b-c1_8 1-72 aa PF02939 UcrQ 10-67 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778155.1`	Pfam	`PF10890`	Cyt_b-c1_8	Family	1	72	3.6e-35	120.9	Cytochrome b-c1 complex subunit 8
`XP_057778155.1`	Pfam	`PF02939`	UcrQ	Family	10	67	2.8e-06	27.9	UcrQ family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922172.1
ACCCATTACCCCCGACACCGCAGTCCAGAACTCAAAACCCAGTGATTAAGGCCCATTACAGCCCAAATGATCTCACGGAGTTTTTTTTTTTTTTTTTAATCACCATTCCATTTTCTTCAATCCTTTACTGCTTTACTCTTCAACTGACCAGAAACTTCTTCCAACCCTAATTACCTCTGCAGATATCTAGAGTGAGACAATATGGGGAAAATACCGGTGAAGATGAAGTCGGTGACGTACGCCCTGTCGCCGTTTCAGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996892
ATGGGGAAAATACCGGTGAAGATGAAGTCGGTGACGTACGCCCTGTCGCCGTTTCAGCAGAAGGTGATGCCGGGCCTCTGGAAGGATTTGTCCGGCAAGATCTCCCACAAGATCTCCGAGAATTGGATCAGCGCCACGCTCCTTCTCAGCCCGCTTGTTGGCACCTATTCGTATGTGCAGTGGTACCTGGAAAAGGAGAAGATGGAGCACAGATACTGA

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778155.1
MGKIPVKMKSVTYALSPFQQKVMPGLWKDLSGKISHKISENWISATLLLSPLVGTYSYVQWYLEKEKMEHRY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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