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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003972`

染色体: Chr08 坐标: 47733476-47735370 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003972`
名称	SmilChr08G003972
描述	uncharacterized SmilChr08G003972
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	47733476 - 47735370 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996879`
GeneID	`130996879`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996879`
原始查询	`SmilChr08G003972`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0006508 (proteolysis); GO:0008234 (cysteine-type peptidase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02902 (Peptidase_C48)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996879

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778141.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057778141.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057778141.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778141.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778141.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:47734369`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B1,C36
`Chr8:47734398`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,C13,C84
`Chr8:47734408`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B16,B19,B30,C6
`Chr8:47734414`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B16,B19,B30,C6
`Chr8:47734424`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B89
`Chr8:47734434`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B19,B36,B87,C79
`Chr8:47734435`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B19,B36,B87,C79
`Chr8:47734439`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	C44,C50,C62,C63,C67
`Chr8:47734457`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	C44,C50,C62,C63,C67
`Chr8:47734457`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	C44,C50,C62,C63,C67
`Chr8:47734469`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,C65
`Chr8:47734485`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B55,C58

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778141.1

232 aa

116

232

Peptidase_C48

PF02902 Peptidase_C48 55-195 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778141.1`	Pfam	`PF02902`	Peptidase_C48	Domain	55	195	8e-14	52.7	Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922158.1
TATGAGGAGAGATTTTACCGCCAAGTATGGGGAACACCGGCTTCTATGCCAACACCAACACCAACACCCACACCACCAGCAAATGCAGACATTGAAGCTGGAATATCAGCCGCAGCGGCAGCACCAGCAACCGCACATCATGAAGCAGGAACATCTGCAGCAGTGGCAACAGCAACAACATCCCCGCCTCAACAATTGGGGCAAATCAGACCAAAAAGGATGAAGATGCCATCTGCAGCATGTAAAAGTCCATTCCGGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996879
ATGTTCTCGGCCGCCATAGACCAAGTATGGAATGAATTACATGGAAAAGATCCGAAAGGCACAACATATGACCCGAAAAGCGAAGAGATCATACAAGAGGAACAAATGAAGAGGCTATGCTTGTTTGCAGTGGGGAAAGAGCCACGATGGGGGGAGTATGTCAAGAAATGGAACGATGTTGAGAAGCTCATCATGATTGTTCACTTCAACAATCACTGGGCCACCTGTTTGGTGAATTTCACGGACCATGAGTTGACGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778141.1
MFSAAIDQVWNELHGKDPKGTTYDPKSEEIIQEEQMKRLCLFAVGKEPRWGEYVKKWNDVEKLIMIVHFNNHWATCLVNFTDHELTIYDSNQHKFDDIHLDIRQCAFMPICRIIPQILKKIGYYEKRNVDGKYTEWIYSYPYDGSNNLKQVDSVSCGVLSLKYVEMMLTGKFVEKNMSKTVLKTFREKIAESIYKFSTDASTFEPLDDEDEQEDAGEGEDDGEGVAAANLRE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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