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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003974`

染色体: Chr08 坐标: 47754383-47755555 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003974`
名称	SmilChr08G003974
描述	uncharacterized SmilChr08G003974
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	47754383 - 47755555 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996880`
GeneID	`130996880`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996880`
原始查询	`SmilChr08G003974`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribosomal protein L1p/L10e family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825035]; symbol=AT3G58660; hit=AT3G58660; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Ribosomal protein L1p/L10e family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825035]; symbol=AT3G58660; hit=AT3G58660; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G58660` (AT3G58660) Ribosomal protein L1p/L10e family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825035] identity=48.9; qcov=0.978; evalue=6.74e-71; confidence=high
Rice	`Os05g0558000` - identity=38.7; qcov=0.752; evalue=1.23e-43; confidence=medium
GO	GO:0030686 (90S preribosome)
KEGG	-
Pfam	PF00687 (Ribosomal_L1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996880

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778142.1`
2	Nucleolus	核仁	1.00000	`XP_057778142.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778142.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778142.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057778142.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:47754394`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,C16,C39,C59,C67
`Chr8:47754396`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,C16,C39,C59,C67
`Chr8:47754410`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,C16,C39,C67
`Chr8:47754439`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr8:47754594`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B45,C34
`Chr8:47754617`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr8:47754678`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr8:47754874`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C67
`Chr8:47755000`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr8:47755015`	`GAT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B70
`Chr8:47755015`	`GAT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778142.1

230 aa

115

230

Ribosomal_L1

PF00687 Ribosomal_L1 40-230 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778142.1`	Pfam	`PF00687`	Ribosomal_L1	Domain	40	230	4.6e-38	131.5	Ribosomal protein L1p/L10e family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922159.1
ATGTCTTCCAACGCAGAACCCGTCGCCGCCGCCACACCTTCAAGGGTGAGTAAGCCCGCCATAGACGCCGGCGTAAGCGCTCTGTTGAAACACAAAGCCGCCCAATCCGTCAACGAGAAGCCCCAATTACTGCCGCAAGATGATTATTTCTCCCTTAACCTCACCCGAAAGAAAATCCCATCAAACCCTCGCACGAATCCCTACAGAATCCCGCTTCCAAACCCCGTTTTGGACGTCGTCAACTCGGAGGTATGTTTAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996880
ATGTCTTCCAACGCAGAACCCGTCGCCGCCGCCACACCTTCAAGGGTGAGTAAGCCCGCCATAGACGCCGGCGTAAGCGCTCTGTTGAAACACAAAGCCGCCCAATCCGTCAACGAGAAGCCCCAATTACTGCCGCAAGATGATTATTTCTCCCTTAACCTCACCCGAAAGAAAATCCCATCAAACCCTCGCACGAATCCCTACAGAATCCCGCTTCCAAACCCCGTTTTGGACGTCGTCAACTCGGAGGTATGTTTAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778142.1
MSSNAEPVAAATPSRVSKPAIDAGVSALLKHKAAQSVNEKPQLLPQDDYFSLNLTRKKIPSNPRTNPYRIPLPNPVLDVVNSEVCLIVDDRPRTTPPPSDEIKKLIKSQNIQISKVIKLSKLRANYKPFEARRKLCNSYDIFLVDKRVVHLLPKLIGKEFFKKQKLPLGVDLGKKNLKLQVERVLGIALLFIGTGTYSVLKVGKVEMEKDEIVENMLDAIKGVIERVPKK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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