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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003976`

染色体: Chr08 坐标: 47833555-47843067 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003976`
名称	SmilChr08G003976
描述	uncharacterized SmilChr08G003976
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	47833555 - 47843067 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996862`
GeneID	`130996862`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996862`
原始查询	`SmilChr08G003976`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	LETM1-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842865]; symbol=LETM2; hit=AT1G65540; species=arabidopsis; confidence=high
产物	LETM1-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842865]; symbol=LETM2; hit=AT1G65540; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G65540` (LETM2) LETM1-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842865] identity=68.7; qcov=0.982; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0496800` - identity=65; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005509 (calcium ion binding); GO:0005743 (mitochondrial inner membrane); GO:0030003 (intracellular monoatomic cation homeostasis); GO:0043022 (ribosome binding)
KEGG	-
Pfam	PF07766 (LETM1_RBD); PF13499 (EF-hand_7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996862

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057778111.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057778111.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	1.00000	`XP_057778111.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778111.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778111.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:47834678`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr8:47834707`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B117,B70
`Chr8:47835070`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B61
`Chr8:47835070`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B61
`Chr8:47835460`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr8:47835518`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B104,B40,C8,D7
`Chr8:47835578`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	A18
`Chr8:47835578`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr8:47836717`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19
`Chr8:47836809`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C64
`Chr8:47839834`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C8,D7
`Chr8:47840238`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778111.1

765 aa

382

765

LETM1_RBD

EF-hand_7

PF07766 LETM1_RBD 247-479 aa PF13499 EF-hand_7 683-745 aa

XP_057778112.1

764 aa

382

764

LETM1_RBD

EF-hand_7

PF07766 LETM1_RBD 247-479 aa PF13499 EF-hand_7 683-745 aa

XP_057778113.1

765 aa

382

765

LETM1_RBD

EF-hand_7

PF07766 LETM1_RBD 247-479 aa PF13499 EF-hand_7 683-745 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778111.1`	Pfam	`PF07766`	LETM1_RBD	Domain	247	479	2.5e-87	293.0	LETM1-like, RBD
`XP_057778111.1`	Pfam	`PF13499`	EF-hand_7	Domain	683	745	2.2e-08	35.0	EF-hand domain pair
`XP_057778112.1`	Pfam	`PF07766`	LETM1_RBD	Domain	247	479	2.5e-87	293.0	LETM1-like, RBD
`XP_057778112.1`	Pfam	`PF13499`	EF-hand_7	Domain	683	745	2.2e-08	35.0	EF-hand domain pair
`XP_057778113.1`	Pfam	`PF07766`	LETM1_RBD	Domain	247	479	2.5e-87	293.0	LETM1-like, RBD
`XP_057778113.1`	Pfam	`PF13499`	EF-hand_7	Domain	683	745	2.2e-08	35.0	EF-hand domain pair

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922129.1
CAAAGTGTATCCCAGCGGTCTCGTCTCTCTATTCGTATCTCTCTCTCTCAATCTTACAGATACGCAACGGCAGGGCACACACATCTCCCACCGCCTCCTGCTCCGGCGAAGGGCGCCGCCATCAGCCACCGCCACCACCGGCATCTCCCCCCTCTTGCCTCTCGCCTTTCGCTCCTTGTCCCCCTTCTATCCTTCACCACGCACGGCGAGGTTGCACGTGCAGCGCCGCCTCCGTCTCCACACCGCGCCGCAATCACCAT...

XM_057922128.1
CAAAGTGTATCCCAGCGGTCTCGTCTCTCTATTCGTATCTCTCTCTCTCAATCTTACAGATACGCAACGGCAGGGCACACACATCTCCCACCGCCTCCTGCTCCGGCGAAGGGCGCCGCCATCAGCCACCGCCACCACCGGCATCTCCCCCCTCTTGCCTCTCGCCTTTCGCTCCTTGTCCCCCTTCTATCCTTCACCACGCACGGCGAGGTTGCACGTGCAGCGCCGCCTCCGTCTCCACACCGCGCCGCAATCACCAT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130996862
ATGATGGCTTCAAGAGCAATATTGCAAAAGAAAAAGTGTCTGCTTGATTCTGTCAAGCGGCCACATTATTTAGTTCCAAGGTTCGTATGTAGTGACCATGGAAGATTGCTAGACATTCCTAATTCACAGCGTGGGAGCTGGCCTCTGATTCTTTCGGATTCAGATAACAGTGAGAAAGAACATTCATATTTTCTAACCAGACAAATGGCTCAACACACTCTGACAAAAAAGTATGCGGGCCATTATTTTGCCAGAGTTCC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057778111.1
MMASRAILQKKKCLLDSVKRPHYLVPRFVCSDHGRLLDIPNSQRGSWPLILSDSDNSEKEHSYFLTRQMAQHTLTKKYAGHYFARVPSLHCEIGVPGELKPLGFRWTIEYVRHLSTAPAGKPELEGDDNKKEPVKQKKEPSPEECDQAVEGLSSVKAKAKAKAKQLQDSSKGVKYIVKKMRAFLLGIGPALRAIASMSREDWANKLRHWKDEFKSTLQHYWLGTKLLWVDVRISLRLLLKLASGRTLSRRERQQLTRTTA...

XP_057778112.1
MMASRAILQKKKCLLDSVKRPHYLVPRFVCSDHGRLLDIPNSQRGSWPLILSDSDNSEKEHSYFLTRQMAQHTLTKKYAGHYFARVPSLHCEIGVPGELKPLGFRWTIEYVRHLSTAPAGKPELEGDDNKKEPVKQKKEPSPEECDQAVEGLSSVKAKAKAKAKQLQDSSKGVKYIVKKMRAFLLGIGPALRAIASMSREDWANKLRHWKDEFKSTLQHYWLGTKLLWVDVRISLRLLLKLASGRTLSRRERQQLTRTTA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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