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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003988`

染色体: Chr08 坐标: 48090054-48091619 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003988`
名称	SmilChr08G003988
描述	translationally-controlled tumor protein homolog
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	48090054 - 48091619 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996884`
GeneID	`130996884`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996884`
原始查询	`SmilChr08G003988`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	translationally-controlled tumor protein homolog
产物	translationally-controlled tumor protein homolog
Arabidopsis	`AT3G16640` (TCTP) translationally controlled tumor protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820916] identity=79.8; qcov=1; evalue=4.12e-96; confidence=high
Rice	`Os11g0660500` (OsTCTP) - identity=83.3; qcov=1; evalue=1.02e-95; confidence=high
GO	GO:0005509 (calcium ion binding); GO:0005737 (cytoplasm)
KEGG	-
Pfam	PF00838 (TCTP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996884

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057778146.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057778146.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057778146.1`
4	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057778146.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778146.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:48090772`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B137,B89,C4
`Chr8:48090950`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr8:48090962`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:48091012`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C28,C33
`Chr8:48091344`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778146.1

168 aa

168

TCTP

PF00838 TCTP 1-164 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778146.1`	Pfam	`PF00838`	TCTP	Domain	1	164	6.9e-60	202.8	Translationally controlled tumour protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922163.1
CCTAGTCTACTACACAAAACACAACTCGGAAACGGTTAAGTTCTCTGCTATATAAACTCGCGGCCCAACCATTATTACTTCATCAATCTCATACTTCTCTCACTGCCTAGATTTCCTCTCGCTTCCTTAAAGATTTTTCGGCTCTTTTGTTGGGATAATAGAAGAGGAAACATGTTGGTTTATCAGGATCTTCTCTCAGGCGATGAGCTGCTCTCTGACTCATTCCCATATAAGGAAATAGAGAATGGGATGCTGTGGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996884
ATGTTGGTTTATCAGGATCTTCTCTCAGGCGATGAGCTGCTCTCTGACTCATTCCCATATAAGGAAATAGAGAATGGGATGCTGTGGGAAGTAGAAGGGAAGTGGGTCGTTCAAGGGGCCGTTAATGTCGATATTGGGGCGAACCCTTCTGCTGAAGGTGGTGACGAAGACGAAGGCGTTGATGATCAAGCTGTCAAGGTTGTGGACATTGTAGACACTTTCCGGCTTCAAGAGCAGCCTCCTTTCGACAAAAAACAGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778146.1
MLVYQDLLSGDELLSDSFPYKEIENGMLWEVEGKWVVQGAVNVDIGANPSAEGGDEDEGVDDQAVKVVDIVDTFRLQEQPPFDKKQFIAYVKKYIKNLTPKLEPEKQEQFKKGIEGATKYLVSKLKDFQFFVGESMHDDGTMVFAYYKEGATDPTFLYLGYGLKEVKC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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