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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003990`

染色体: Chr08 坐标: 48105356-48110826 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003990`
名称	SmilChr08G003990
描述	uncharacterized SmilChr08G003990
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	48105356 - 48110826 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996864`
GeneID	`130996864`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996864`
原始查询	`SmilChr08G003990`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Phospholipid/glycerol acyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819716]; symbol=AT3G05510; hit=AT3G05510; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Phospholipid/glycerol acyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819716]; symbol=AT3G05510; hit=AT3G05510; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G05510` (AT3G05510) Phospholipid/glycerol acyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819716] identity=55.2; qcov=0.977; evalue=2.66e-174; confidence=high
Rice	`Os01g0931300` (P0506E04.19-1) - identity=50.1; qcov=1; evalue=7.1e-152; confidence=high
GO	GO:0006644 (phospholipid metabolic process); GO:0008374 (GO:0008374)
KEGG	smil00564 (Glycerophospholipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01553 (Acyltransferase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996864

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057778115.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057778115.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778115.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778115.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778115.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:48106031`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778115.1

469 aa

234

469

Acyltransferase

PF01553 Acyltransferase 129-263 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778115.1`	Pfam	`PF01553`	Acyltransferase	Family	129	263	3.8e-16	59.8	Acyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922132.1
AAAGTAATCCGCTACTTTAGCGGGAAGGAGTACTAATATAGAGTGGGAGTGGCACAACAATCCCCAATTAGCTAATCTCTCTTTTAAACGCTTCTCGCCGTCTCTCTCTCTCTCTCTCACAGAATCCGCGGATCCATTAACACCAGCTACAGACAATTGACTGCTCTTTATTTTACTGATTCTCCTCACATTTATGTGAATTTGGCCGTTTACGGCGTCCAGTGTTTAGCTTAGAAAGATGGTGGCGGCGGGGCGGTGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996864
ATGGTGGCGGCGGGGCGGTGGCTGGAATGCAGAGGCGACCTGTTGGCGGAGGGGGCTAAATCGCTGCAGCTTAGGCTGAGGGACCGTTTCAGAGTTGCTGCGGTGGACTATCACCGCCGCCGGAACTTGAGGACTACCAGCGCCGGCTACTTGTCCTCCAGCGTTCAGCGCTGGCTCGATCGCTTCTCCGAATTCCGTCGCGATTCTCTGCCTTCATCTTCCACATTTTACCGCAAAAGAGTGAGCAAGGATATTGATGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778115.1
MVAAGRWLECRGDLLAEGAKSLQLRLRDRFRVAAVDYHRRRNLRTTSAGYLSSSVQRWLDRFSEFRRDSLPSSSTFYRKRVSKDIDAEDESVLTRMLQAVAVPVLGNVCHVFMHGLNRVQIFGAEKLQQVVTHRPENKSLITVSNHVASMDDPLVIASLLPPSILFDANGLRWTLCASDRCFKNPVTSAFFKSVKVLPVSRGDGIYQKGMDLAISKLNGGGWVHIFPEGSRSRDGGKTMGSAKRGIGRLVLDADNTPIVV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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