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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003994`

染色体: Chr08 坐标: 48205975-48208545 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003994`
名称	SmilChr08G003994
描述	uncharacterized SmilChr08G003994
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	48205975 - 48208545 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998576`
GeneID	`130998576`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998576`
原始查询	`SmilChr08G003994`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0208400; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os08g0208400; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0208400` - identity=39; qcov=0.935; evalue=0; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02992 (Transposase_21); PF13960 (DUF4218); PF13963 (Transpos_assoc)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998576

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779975.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779975.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779975.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779975.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057779975.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:48206080`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,B91
`Chr8:48206091`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D3
`Chr8:48206091`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr8:48206148`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	20	A18,B104,B106,B108,B109,B115,B131,B53,B56,B96,C16,C2,C34,C42,C43,C53,C72,C73,C80,D4
`Chr8:48206152`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	A10,A22,B127,C21,C36,C53,C64,C66,D2
`Chr8:48206184`	`CCG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	C36,C64,C66,D2
`Chr8:48206184`	`CCG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	4	C36,C64,C66,D2
`Chr8:48206188`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	C36,C64,C66,D2
`Chr8:48206188`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	CDS_variant	4	C36,C64,C66,D2
`Chr8:48206197`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C64,C66,D2
`Chr8:48206218`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C64,C66,D2
`Chr8:48206226`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779975.1

856 aa

428

856

Transpos_assoc

Transposase_21

DUF4218

PF13963 Transpos_assoc 3-75 aa PF02992 Transposase_21 274-485 aa PF13960 DUF4218 665-769 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779975.1`	Pfam	`PF13963`	Transpos_assoc	Domain	3	75	2.9e-21	76.1	Transposase-associated domain
`XP_057779975.1`	Pfam	`PF02992`	Transposase_21	Family	274	485	1.1e-96	322.9	Transposase family tnp2
`XP_057779975.1`	Pfam	`PF13960`	DUF4218	Domain	665	769	2.2e-43	147.4	Domain of unknown function (DUF4218)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923992.1
ATGGATAAATCATGGATGTTAAAGAACAGGCTGAGTGATGAGTATAAGAATGGGGTAGAGTCTTTCATGGAATTTGCCATACAAAATGACACCAATAATGAATTGATGTCATGCCCATGCTCGAAATGTGGAAATTTGATGAGGAAAAAGATTGACCTAGTACGGTTGCATTTGTTGAGTAATGGAATGGACTTAACATATCATACATGGATATGGCATGGAGAAAGATCTACACGAAGTTACTCAACGAAATATGAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998576
ATGGATAAATCATGGATGTTAAAGAACAGGCTGAGTGATGAGTATAAGAATGGGGTAGAGTCTTTCATGGAATTTGCCATACAAAATGACACCAATAATGAATTGATGTCATGCCCATGCTCGAAATGTGGAAATTTGATGAGGAAAAAGATTGACCTAGTACGGTTGCATTTGTTGAGTAATGGAATGGACTTAACATATCATACATGGATATGGCATGGAGAAAGATCTACACGAAGTTACTCAACGAAATATGAAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779975.1
MDKSWMLKNRLSDEYKNGVESFMEFAIQNDTNNELMSCPCSKCGNLMRKKIDLVRLHLLSNGMDLTYHTWIWHGERSTRSYSTKYENEFEHQERNFVHEEPIDMVHAAYEEFDNPSKFIKLLEDAEKPLYPGCVKFTKLSAIVKLFNLKAKHSWSDKSFTDLLTILGDMLPSPNELPPTIYDAKKSLAALGMEYEKIHACPNDCVLYRKEYEHCVSCPTCGVSRWKECMNSSMKNSIPAKVLWYFPPIPRFQRMYRNKDI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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