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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003997`

染色体: Chr08 坐标: 48246052-48246504 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003997`
名称	SmilChr08G003997
描述	uncharacterized SmilChr08G003997
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	48246052 - 48246504 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998577`
GeneID	`130998577`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998577`
原始查询	`SmilChr08G003997`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0627900; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os03g0627900; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os03g0627900` - identity=35.6; qcov=1.19; evalue=3.67e-21; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF24626 (SH3_Tf2-1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998577

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057779977.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057779977.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779977.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779977.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779977.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:48246070`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,B21
`Chr8:48246082`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	B104,B119,B3,B33,B52,B65,C24,C35,D4,D9
`Chr8:48246094`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	198	A1,A10,A11,A13,A14,A15,A16,A18,A19,A2,A20,A22,A23,A24,A25,A3,A4,A7,A9,B1,B10,B103,B104,B105,B107,B109,B110,B111,B112,B113,B114,B115,B117,B118,B119,B120,B121,B122,B123,B125,B126,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B137,B138,B16,B18,B19,B2,B21,B22,B23,B24,B25,B26,B27,B28,B3,B30,B31,B32,B33,B34,B35,B36,B37,B38,B39,B4,B41,B44,B45,B47,B48,B49,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B55,B57,B58,B59,B60,B62,B63,B64,B65,B66,B67,B68,B69,B70,B71,B74,B75,B76,B77,B78,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B85,B86,B89,B9,B91,B93,B94,B95,B96,B99,C12,C13,C14,C15,C18,C19,C2,C20,C21,C24,C25,C26,C27,C28,C3,C30,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C37,C4,C40,C41,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C50,C52,C53,C54,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C60,C61,C62,C64,C66,C67,C68,C7,C70,C72,C73,C74,C76,C78,C79,C8,C82,C83,C84,C85,C86,C87,C9,D10,D11,D2,D3,D4,D5,D6,D7,D8,D9
`Chr8:48246118`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B134,B69,B9,C1,C50,D10
`Chr8:48246123`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:48246129`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B80,C61,D11
`Chr8:48246131`	`C`	`CGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	A24,B57,C80
`Chr8:48246131`	`C`	`CGT`	2bp_insertion	CDS_variant	3	A24,B57,C80
`Chr8:48246140`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B110,B38,C12,C23,C78
`Chr8:48246156`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	98	A11,A18,A2,A24,A5,A7,B1,B101,B102,B103,B11,B118,B12,B124,B127,B13,B131,B134,B136,B14,B15,B16,B17,B19,B20,B21,B22,B28,B30,B31,B32,B33,B36,B47,B48,B49,B5,B51,B52,B54,B55,B58,B6,B64,B65,B67,B68,B7,B70,B72,B73,B75,B76,B79,B80,B81,B89,B90,B94,C1,C10,C11,C13,C2,C26,C28,C29,C31,C32,C35,C36,C39,C42,C44,C45,C5,C50,C51,C52,C54,C56,C57,C58,C60,C61,C65,C7,C71,C72,C74,C75,C78,C8,C80,C82,C87,D4,D8
`Chr8:48246160`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr8:48246169`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B69,C1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779977.1

125 aa

125

SH3_Tf2-1

PF24626 SH3_Tf2-1 39-82 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779977.1`	Pfam	`PF24626`	SH3_Tf2-1	Domain	39	82	4.6e-09	37.0	Tf2-1-like, SH3 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923994.1
ATGGTCCAAGAAAATATAGATGTCGTGGCACAGATTAGCAAGCGAATCAAAGAAGCTCAAGACAGACAAAAGTCTTACACAGACAAGCGAAGAAGAGAATTAACCTTTGAGGTAGGAGACAAGGTCTTCCTCAGAGTATCACCAATGAAAGGGATGGTGCGATTCCACAAGCGAGGAAAACTGCGCCTTCGCTTCATCGGGCTGTTTGAAATACTAGAAAAGCTCAGAAAATACGTGTATGATCTCAACCACGTGATATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998577
ATGGTCCAAGAAAATATAGATGTCGTGGCACAGATTAGCAAGCGAATCAAAGAAGCTCAAGACAGACAAAAGTCTTACACAGACAAGCGAAGAAGAGAATTAACCTTTGAGGTAGGAGACAAGGTCTTCCTCAGAGTATCACCAATGAAAGGGATGGTGCGATTCCACAAGCGAGGAAAACTGCGCCTTCGCTTCATCGGGCTGTTTGAAATACTAGAAAAGCTCAGAAAATACGTGTATGATCTCAACCACGTGATATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779977.1
MVQENIDVVAQISKRIKEAQDRQKSYTDKRRRELTFEVGDKVFLRVSPMKGMVRFHKRGKLRLRFIGLFEILEKLRKYVYDLNHVISYDDLTFEPDLGYVEKPVCISDRKIQVLRNKEILMVKVI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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