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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004000`

染色体: Chr08 坐标: 48315694-48316602 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004000`
名称	SmilChr08G004000
描述	uncharacterized SmilChr08G004000
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	48315694 - 48316602 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998578`
GeneID	`130998578`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998578`
原始查询	`SmilChr08G004000`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03004 (Transposase_24)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998578

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779978.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779978.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779978.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779978.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057779978.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:48315710`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,A5
`Chr8:48315750`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	28	A7,B105,B11,B114,B129,B13,B137,B140,B23,B39,B46,B60,B65,B69,B76,B98,C16,C42,C67,C68,C69,C73,C79,C80,C86,D10,D3,D7
`Chr8:48315756`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr8:48315771`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C47,C58
`Chr8:48315781`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B7,C69
`Chr8:48315807`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	A23,B125,B59,B70,B84,C82
`Chr8:48315830`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	24	B101,B105,B11,B124,B16,B17,B20,B28,B47,B48,B64,B65,B95,C11,C26,C30,C39,C52,C69,C76,C8,D1,D10,D11
`Chr8:48315877`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B11,C28,C44,C53,C61
`Chr8:48315877`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B11,C28,C44,C53,C61
`Chr8:48315983`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	A10,B125,B131,B56,B64,B96,C36,C54,D3
`Chr8:48316000`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr8:48316019`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	A14,B109,B123,B81,B83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779978.1

174 aa

174

Transposase_24

PF03004 Transposase_24 102-159 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779978.1`	Pfam	`PF03004`	Transposase_24	Family	102	159	1.1e-10	42.5	Plant transposase (Ptta/En/Spm family)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923995.1
TTATGAATTATTAAATGTTAGTTTTATTACTAATGACTTTGAATGTTAATTGTAGCCAATTACATCCCTTGGGGATGGTTCCAGGCACAGTCACTAAGATTTTCAAGCAAGTTCAAAATCCAGAAGGTTTCAATTGGAAACTCACTCCACCTGCTATCAAGACATCGTACTTTGAGGAATTTAAGAAACATTTCACATGGGATCCGGCGATAGAGGCAGATGTCTATAAGCTTTGGTTAGAGGTTGCTGCGCAGAGGTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998578
ATGTTAGTTTTATTACTAATGACTTTGAATGTTAATTGTAGCCAATTACATCCCTTGGGGATGGTTCCAGGCACAGTCACTAAGATTTTCAAGCAAGTTCAAAATCCAGAAGGTTTCAATTGGAAACTCACTCCACCTGCTATCAAGACATCGTACTTTGAGGAATTTAAGAAACATTTCACATGGGATCCGGCGATAGAGGCAGATGTCTATAAGCTTTGGTTAGAGGTTGCTGCGCAGAGGTATAAGGATTTTGTTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779978.1
MLVLLLMTLNVNCSQLHPLGMVPGTVTKIFKQVQNPEGFNWKLTPPAIKTSYFEEFKKHFTWDPAIEADVYKLWLEVAAQRYKDFVFDIKKKKNKRPSFIHEDHWPNWLKYWDSDEFKAKSEIAKKCRMSEPLGPGTGQVKHKGGSRSILQYAEDVEKMQELVVSQSQPVDDDS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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