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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004013`

染色体: Chr08 坐标: 48507054-48507529 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004013`
名称	SmilChr08G004013
描述	uncharacterized SmilChr08G004013
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	48507054 - 48507529 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998579`
GeneID	`130998579`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998579`
原始查询	`SmilChr08G004013`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998579

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057779979.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057779979.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057779979.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779979.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779979.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:48507076`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,D11
`Chr8:48507171`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr8:48507176`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B27,B65,B74,C11,C69
`Chr8:48507180`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B27,B65,B74,C11,C69
`Chr8:48507270`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B13
`Chr8:48507270`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B13
`Chr8:48507273`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B28,B7,B80,C62,D6
`Chr8:48507300`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:48507312`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B45
`Chr8:48507316`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	14	A10,A18,B10,B101,B19,B22,B24,B38,B39,B68,B84,B91,C12,C3
`Chr8:48507320`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B28,B7,B80,C62,D6
`Chr8:48507320`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B28,B7,B80,C62,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779979.1

137 aa

137

RVT_3

PF13456 RVT_3 16-95 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779979.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	16	95	4e-09	37.2	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923996.1
ATGGTTCTTATGATTCATAGGCGCATTGTGGTGTGGGTGGAGGAGTGTTTTGAGGCCGAGCTTGCTGCGCTGCTTGAGAATCTGAAGTTAGCTGTGACATTGTCTTCTCATATCTGGGTTGAGCTGGATGCTGCAGTGCTCGTTTTGCTCATGTCTGCTGGGCATCACGGTCATGCTAGTATCCGATATTTTGTTGCCTGGATTCGACTGCTTATTCGACACCGGCAGGTTCGATTCACTCACATCCATCGCGAGGGAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998579
ATGGTTCTTATGATTCATAGGCGCATTGTGGTGTGGGTGGAGGAGTGTTTTGAGGCCGAGCTTGCTGCGCTGCTTGAGAATCTGAAGTTAGCTGTGACATTGTCTTCTCATATCTGGGTTGAGCTGGATGCTGCAGTGCTCGTTTTGCTCATGTCTGCTGGGCATCACGGTCATGCTAGTATCCGATATTTTGTTGCCTGGATTCGACTGCTTATTCGACACCGGCAGGTTCGATTCACTCACATCCATCGCGAGGGAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779979.1
MVLMIHRRIVVWVEECFEAELAALLENLKLAVTLSSHIWVELDAAVLVLLMSAGHHGHASIRYFVAWIRLLIRHRQVRFTHIHREGNHLEDFMARQGHQTQALTTFDSESTPRYFLALVKMDQFGYPNFRFRYHVDS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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