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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004017`

染色体: Chr08 坐标: 48576747-48583344 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004017`
名称	SmilChr08G004017
描述	PWWP domain-containing protein 1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	48576747 - 48583344 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996917`
GeneID	`130996917`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996917`
原始查询	`SmilChr08G004017`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	PWWP domain-containing protein 1-like
产物	PWWP domain-containing protein 1-like
Arabidopsis	`AT5G27650` (AT5G27650) Tudor/PWWP/MBT superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832827] identity=59.2; qcov=0.28; evalue=6.09e-98; confidence=weak
Rice	`Os05g0149200` - identity=42.4; qcov=0.195; evalue=3.61e-38; confidence=weak
GO	-
KEGG	smil00270 (Cysteine and methionine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04148 (Efferocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00855 (PWWP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996917

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778172.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778172.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778172.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057778172.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057778172.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:48577051`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C51
`Chr8:48577051`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C51
`Chr8:48577227`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B41,B71,B89,C30,C70
`Chr8:48577416`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	142	A1,A11,A13,A19,A20,A21,A22,A24,A3,A4,A7,A8,A9,B101,B102,B103,B105,B106,B107,B109,B11,B111,B112,B114,B117,B119,B12,B122,B124,B126,B127,B129,B130,B133,B134,B135,B137,B139,B14,B140,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B22,B23,B25,B26,B28,B30,B33,B35,B36,B40,B42,B43,B45,B46,B48,B5,B50,B55,B58,B6,B62,B64,B65,B66,B67,B68,B71,B75,B76,B8,B80,B81,B84,B85,B87,B9,B93,B94,B95,C1,C10,C11,C13,C15,C17,C19,C2,C21,C22,C23,C24,C26,C28,C29,C30,C33,C34,C38,C4,C40,C44,C45,C47,C48,C5,C50,C51,C53,C55,C59,C60,C62,C63,C69,C70,C71,C72,C74,C76,C77,C79,C8,C82,C83,C84,C85,C87,C9,D1,D11,D3,D5,D6,D7,D8,D9
`Chr8:48577429`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:48577551`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr8:48577552`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr8:48577639`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr8:48577671`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B122,B123,B128,B17
`Chr8:48577868`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:48577909`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr8:48577924`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778172.1

1061 aa

530

1061

PWWP

PF00855 PWWP 144-228 aa

XP_057778173.1

1043 aa

522

1043

PWWP

PF00855 PWWP 144-228 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778172.1`	Pfam	`PF00855`	PWWP	Domain	144	228	2.6e-19	70.2	PWWP domain
`XP_057778173.1`	Pfam	`PF00855`	PWWP	Domain	144	228	5.9e-19	69.1	PWWP domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922189.1
GTGTTATTGCGTAGCTAAGCCACTCATACTTTTCCATGTTTCACAAGTCACGACGCACTACTCCCCCCCGTTCCTTCTCCTAGTCCTAGGGTTCTAGTTTTTCCCCCAAATTCAAATACTGTGATTCGGATAATTATCAATTCTTCCTTGTTTGAAATTGCGGTTTAGTGATTCGGGCTGAAACAGATCGGCTCTCGGTGTATGGGACGATATTCGCGATGAGCGCCAGCAGCAACGGCGGTCCCGGGTCGCCTTCAAGC...

XM_057922190.1
GTAGCTAAGCCACTCATACTTTTCCATGTTTCACAAGTCACGACGCACTACTCCCCCCCGTTCCTTCTCCTAGTCCTAGGGTTCTAGTTTTTCCCCCAAATTCAAATACTGTGATTCGGATAATTATCAATTCTTCCTTGTTTGAAATTGCGGTTTAGTGATTCGGGCTGAAACAGATCGGCTCTCGGTGTATGGGACGATATTCGCGATGAGCGCCAGCAGCAACGGCGGTCCCGGGTCGCCTTCAAGCCGGGAGAACG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130996917
ATGAGCGCCAGCAGCAACGGCGGTCCCGGGTCGCCTTCAAGCCGGGAGAACGACACCGTAAGAGAAGAAGACCAGACAGCCCCTTCAACCAGCGGCGGCGATTCTGCCGAACGTTCGGGATCCAATACAGCGGGTTCTATCGCAGAATCAGCTGGAGTTTCACCTGCCGATGAAGATAAACCAGTTGAAGAGAGGTTTTCTGATGATTTTAATGAGTATACGGCTTTGAAGCCAGAAGATGCGGATATTGGAATTAGTGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057778172.1
MSASSNGGPGSPSSRENDTVREEDQTAPSTSGGDSAERSGSNTAGSIAESAGVSPADEDKPVEERFSDDFNEYTALKPEDADIGISDASGGGDARNQPSSSVSKKTKKRKAKGSVHDYDSMLSEFDQFASKGANEAVGYGYEIGDMVWGKVKSHPWWPGHIYNEALASPSVHRSKREGHVLVAFFGDSSYGWYDPAELIPFEENFLEKSQQTSSRPFLKAVTEAVDELSRRRALGLACRCGNEFNFWPSSVEDYFVVDVG...

XP_057778173.1
MSASSNGGPGSPSSRENDTVREEDQTAPSTSGGDSAERSGSNTAGSIAESAGVSPADEDKPVEERFSDDFNEYTALKPEDADIGISDASGGGDARNQPSSSVSKKTKKRKAKGSVHDYDSMLSEFDQFASKGANEAVGYGYEIGDMVWGKVKSHPWWPGHIYNEALASPSVHRSKREGHVLVAFFGDSSYGWYDPAELIPFEENFLEKSQQTSSRPFLKAVTEAVDELSRRRALGLACRCGNEFNFWPSSVEDYFVVDVG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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