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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004019`

染色体: Chr08 坐标: 48629175-48630323 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004019`
名称	SmilChr08G004019
描述	uncharacterized SmilChr08G004019
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	48629175 - 48630323 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998582`
GeneID	`130998582`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998582`
原始查询	`SmilChr08G004019`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aspartyl protease gag-polyprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717693]; symbol=AT2G06105; hit=AT2G06105; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	aspartyl protease gag-polyprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717693]; symbol=AT2G06105; hit=AT2G06105; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT2G06105` (AT2G06105) aspartyl protease gag-polyprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717693] identity=37.7; qcov=0.181; evalue=1.45e-06; confidence=weak
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998582

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057779981.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057779981.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057779981.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779981.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779981.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:48629179`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B123,B19,B67,C39,C78
`Chr8:48629180`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B120,B41,B66,C10,C46
`Chr8:48629187`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B17,B35,C87
`Chr8:48629187`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B17,B35,C87
`Chr8:48629190`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B120,B41,B66,C10,C46
`Chr8:48629202`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	13	B103,B110,B117,B122,B18,B22,B52,B9,C15,C33,C36,C62,C69
`Chr8:48629207`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B52,C68
`Chr8:48629210`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B6,C8
`Chr8:48629211`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B123,B19,C39,C78
`Chr8:48629226`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134
`Chr8:48629233`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B39
`Chr8:48629239`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B3,B64,C1,C16,C42

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923998.1
ATGGCCCAACAACAAGTGAAGTTCCAGCAAGAGACCGAAAAGTTCATAATGGAGACGAGAGGAGGAATGCAGAATGTGAACTCCCAACTATCACATCTTGCCCAAGCAGTCGCCAGACTTGAAAGTAAACAAGGGACACTTCCATCCCAAGTGGAGGTGAAGAAGGTGAATGCCATGACACTCAGAGGAGGAAAGGAGTTGCCCGAGGTTGATAAGGAGAAAAACAAAGAAAAGCTAGAGATCAACGAGCAAGTCGGAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998582
ATGGCCCAACAACAAGTGAAGTTCCAGCAAGAGACCGAAAAGTTCATAATGGAGACGAGAGGAGGAATGCAGAATGTGAACTCCCAACTATCACATCTTGCCCAAGCAGTCGCCAGACTTGAAAGTAAACAAGGGACACTTCCATCCCAAGTGGAGGTGAAGAAGGTGAATGCCATGACACTCAGAGGAGGAAAGGAGTTGCCCGAGGTTGATAAGGAGAAAAACAAAGAAAAGCTAGAGATCAACGAGCAAGTCGGAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779981.1
MAQQQVKFQQETEKFIMETRGGMQNVNSQLSHLAQAVARLESKQGTLPSQVEVKKVNAMTLRGGKELPEVDKEKNKEKLEINEQVGMGSADEEEFAQEQEAKRKATGKGKEKSSQTEPRLPFPDRMAKEQEKEELTELVKIFKKVEVNIPLLVAPRSMPRCAKFLKELCTRKVKYTDDAKFQVGESVSAVLQRDMPIKCGDPGMFYIPCVIGTMKVEKAMLDLGASINVMPLSMYRDLEIGPLKPTRVVIQLADRSNVYP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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