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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004021`

染色体: Chr08 坐标: 48647032-48648631 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004021`
名称	SmilChr08G004021
描述	psbP domain-containing protein 7, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	48647032 - 48648631 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996948`
GeneID	`130996948`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996948`
原始查询	`SmilChr08G004021`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	psbP domain-containing protein 7, chloroplastic
产物	psbP domain-containing protein 7%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G05410` (AT3G05410) Photosystem II reaction center PsbP family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819705] identity=69.1; qcov=0.983; evalue=1.29e-84; confidence=high
Rice	`Os01g0934400` - identity=62.1; qcov=0.994; evalue=1.22e-76; confidence=high
GO	GO:0005509 (calcium ion binding); GO:0009523 (photosystem II); GO:0009654 (photosystem II oxygen evolving complex); GO:0015979 (photosynthesis); GO:0019898 (extrinsic component of membrane)
KEGG	-
Pfam	PF01789 (PsbP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996948

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057778217.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057778217.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	1.00000	`XP_057778217.1`
4	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057778218.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778217.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:48647251`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	16	A13,A21,B118,B125,B128,B63,B72,B76,B8,C17,C2,C51,C57,C58,C83,D9
`Chr8:48647286`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr8:48647354`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B106,B62,C34,C72
`Chr8:48647364`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,B103,B137
`Chr8:48647784`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:48647834`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr8:48647849`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:48648249`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr8:48648380`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778217.1

272 aa

136

272

PsbP

PF01789 PsbP 88-271 aa

XP_057778218.1

178 aa

178

PsbP

PF01789 PsbP 61-177 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778217.1`	Pfam	`PF01789`	PsbP	Domain	88	271	1.2e-26	94.3	PsbP
`XP_057778218.1`	Pfam	`PF01789`	PsbP	Domain	61	177	2.2e-22	80.5	PsbP

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922235.1
TTTTGGTATTATTTCAAATAAATCGTTCGAGATATTTTTGTTAAAGTTGGCAAATAAAAGAAACTGTGGTATTATGCGAGTCATTTTGGAGTAAAGAAGTAAGTAGAAAGAGAATAATATGGTTTGCATAAGTGAGGTGAGGGAGAGAAATATGAACCACCAGAAATGGATCACAAAATCCAGCACGCCCATGGATTCAATCAACTCCAGATTCGAAATCACAAACTCATAACTGAAAAACGAGAATGATAGGCGCGCAA...

XM_057922234.1
ATAAAAGAAACTGTGGTATTATGCGAGTCATTTTGGAGTAAAGAAGTAAGTAGAAAGAGAATAATATGGTTTGCATAAGTGAGGTGAGGGAGAGAAATATGAACCACCAGAAATGGATCACAAAATCCAGCACGCCCATGGATTCAATCAACTCCAGATTCGAAATCACAAACTCATAACTGAAAAACGAGAATGATAGGCGCGCAATATACCTTTCAATCGCGCACTTTCAGCCGGATTTGCATGACGCAATCTTCCGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130996948
ATGATAGGCGCGCAATATACCTTTCAATCGCGCACTTTCAGCCGGATTTGCATGACGCAATCTTCCGATGACGACGGACTGGCGCCGGCGGACCAGTTCAGGCCGCTTCAGTCCGTCTTCCGGCGCCGCCTCCTCACGGGAGTCGGCGCCGCTTCTCTGCTCGCCGTCGGCGCGAATTTCGGCGGAGTGACGAGCTTCCTCTTGGGCTTCACGCCGGGGGCTGCTCGGAGCCTCAGGCTCGACGCCCTCTACCCCGTCGG...

LOC130996948
ATGAAGGATTTGGTCAAATTTGTGTATCCGGAGAGGTGGTTGGGGGATCAGACATTGTTGTATAGAGCAGCTGGAAAGGCGGAAAGGTCGCTGGATCCTCCTCCCTTGAGCGGCGGCGGTGCGCGGCGGCGCAATGTGAATGAGCCTGTGGTGGCGTTTGGGCCGCCGGGATCAACCGGAGAGCTCAATGTCAGCGTTATTGTGTCGCCTGTCCCCATTGATTTCTCGATTGAGGCATTTGGAGGAGCTAACGACGTGGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057778217.1
MIGAQYTFQSRTFSRICMTQSSDDDGLAPADQFRPLQSVFRRRLLTGVGAASLLAVGANFGGVTSFLLGFTPGAARSLRLDALYPVGGYSRYIDTDEGFEFVYPERWLGDQTLLYRAAGKAERSLDPPPLSGGGARRRNVNEPVVAFGPPGSTGELNVSVIVSPVPIDFSIEAFGGANDVGEAFIRSITRSGKAADLKGTLTGTSLREDAERNVKYYELEFGVESSIFRRHNLAVCCARKGRLFTLNAQAPESAWPHFKS...

XP_057778218.1
MKDLVKFVYPERWLGDQTLLYRAAGKAERSLDPPPLSGGGARRRNVNEPVVAFGPPGSTGELNVSVIVSPVPIDFSIEAFGGANDVGEAFIRSITRSGKAADLKGTLTGTSLREDAERNVKYYELEFGVESSIFRRHNLAVCCARKGRLFTLNAQAPESAWPHFKSQLHTIAASFNVV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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