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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004025`

染色体: Chr08 坐标: 48670444-48671559 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004025`
名称	SmilChr08G004025
描述	nuclear transcription factor Y subunit B-4-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	48670444 - 48671559 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996961`
GeneID	`130996961`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996961`
原始查询	`SmilChr08G004025`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nuclear transcription factor Y subunit B-4-like
产物	nuclear transcription factor Y subunit B-4-like
Arabidopsis	`AT2G47810` (NF-YB5) nuclear factor Y, subunit B5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819393] identity=67.3; qcov=0.646; evalue=7.45e-51; confidence=high
Rice	`Os01g0935200` (OsHAP3G) - identity=75.8; qcov=0.59; evalue=1.13e-50; confidence=medium
GO	GO:0000978 (RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding); GO:0001228 (DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II); GO:0016602 (CCAAT-binding factor complex); GO:0046982 (protein heterodimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF00125 (Histone); PF00808 (CBFD_NFYB_HMF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996961

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778237.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778237.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778237.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057778237.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057778237.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:48670955`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:48670958`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	14	B117,B29,B37,B75,B87,B9,B90,B92,B98,C15,C42,C45,C50,C7
`Chr8:48670966`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C61
`Chr8:48670966`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C61
`Chr8:48671097`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,C64,C66,C67
`Chr8:48671116`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778237.1

161 aa

161

Histone

CBFD_NFYB_HMF

PF00125 Histone 4-72 aa PF00808 CBFD_NFYB_HMF 8-72 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778237.1`	Pfam	`PF00125`	Histone	Domain	4	72	8.9e-08	33.1	Core histone H2A/H2B/H3/H4 domain
`XP_057778237.1`	Pfam	`PF00808`	CBFD_NFYB_HMF	Domain	8	72	6.5e-27	94.3	Histone-like transcription factor (CBF/NF-Y) and archaeal histone

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922254.1
GGTTAATGCCACATATTAAAGTCTTACGTTTTGGCATCAATTTAATTTGTTTCCTTGTTGGCATAAGTTCTTAGTGGTATACATATACACACCAATGGAGTGGATATGTTATTTCTTTATCCCTATATAAATTAAGTTTCCATCTATAGTAACATCCACATATTAATTAAGGCAAAAATAAATTTGTGGGTACTACCCACCCCTACCAAGTATGAAGAAAGGGCACTTCCACAAAAGGATGACATAAATGTAGCTAATGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996961
ATGACGGATGAGAGCGATAGATTGCTCCCGATCGCGAATGTGGGGCGGATCATGAAGAAGATCCTCCCCACAAGCGCCAAGATCTCTAAAGAAGCCAAAGAGACAATGCAAGAATGTGTATCAGAGTTCATAGGCTTCGTGACGAGCGAGGCGTCGGAGCGGTGCCACAAGGAGAACCGGAAGACGGTGAACGGAGACGACATCTGCTGGGCCCTCAGCTCCCTCGGATTCGACAACTACTCCGACACGATGCCGAGGTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778237.1
MTDESDRLLPIANVGRIMKKILPTSAKISKEAKETMQECVSEFIGFVTSEASERCHKENRKTVNGDDICWALSSLGFDNYSDTMPRYLQRLREIERQRAKQQGERKMKEGCCQCTPSSPPSLHFLAILERDGGGERERESSSSSSAKTSQLDNNTCILRKN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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