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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004050`

染色体: Chr08 坐标: 48996375-48999359 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004050`
名称	SmilChr08G004050
描述	U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	48996375 - 48999359 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996952`
GeneID	`130996952`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996952`
原始查询	`SmilChr08G004050`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein-like
产物	U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein-like
Arabidopsis	`AT2G43370` (AT2G43370) RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818938] identity=76.4; qcov=0.859; evalue=6.01e-117; confidence=high
Rice	`Os09g0513700` - identity=70.9; qcov=0.931; evalue=5.16e-124; confidence=high
GO	GO:0000398 (mRNA splicing, via spliceosome); GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005689 (U12-type spliceosomal complex); GO:0017069 (snRNA binding); GO:0071011 (precatalytic spliceosome)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996952

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778221.1`
2	Nuclear speckle	核斑点	0.60000	`XP_057778221.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057778221.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778221.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778221.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:48996518`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr8:48996561`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,B68
`Chr8:48996771`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,B49,C32,C68
`Chr8:48996775`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr8:48996930`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B128,B17
`Chr8:48999094`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B36,B77
`Chr8:48999163`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B113,B52,C10,C60
`Chr8:48999180`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778221.1

262 aa

131

262

RRM_1

PF00076 RRM_1 73-142 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778221.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	73	142	3.3e-19	69.2	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922238.1
TAATTTAAATGTCAACTGTTTCTACGCTAGTAGGATTCGAACCCCAGAGCTGAAGCTAGAATTGTGTAGTTCGGATTCGCGAAAATGAGCCGCCGCGGCGGTGGCGGAGACGGCGGCAGCAGCAGCAGTATGAGTTCAGTATTCTACGCAGATGAATACCATCCTATCCAAGCCGGCAGCATCGACGGTACCGACATTCTTCCCCACGACAACGGCGTCTACAGAGCTCTCCTTTGCTCCAAAGCAGCCCTATATGACCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996952
ATGAGCCGCCGCGGCGGTGGCGGAGACGGCGGCAGCAGCAGCAGTATGAGTTCAGTATTCTACGCAGATGAATACCATCCTATCCAAGCCGGCAGCATCGACGGTACCGACATTCTTCCCCACGACAACGGCGTCTACAGAGCTCTCCTTTGCTCCAAAGCAGCCCTATATGACCCCTTCGGCGACCCTAAAGTCACCGGCGACCCTTATTGCACTCTCTTCGTCGGCCGTCTCTCTCATCTCACCACCGAGGACACTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778221.1
MSRRGGGGDGGSSSSMSSVFYADEYHPIQAGSIDGTDILPHDNGVYRALLCSKAALYDPFGDPKVTGDPYCTLFVGRLSHLTTEDTLRKAMSEYGRVKNLRLVRNIVTGASRGYAFVEFETEKDMRRAYKDAHHTFIDDSEIIVDYNRQQLMPGWIPRRLGGGLGGKKESGQLRFGGRERPFRAPLKQIPFDDLKRLGIPPPPEGRYMSRFQIPSPPRRKRSSSSDLDEKEKRDSKQHRRARHSSSWRPSSRDRSRVDER...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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