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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004051`

染色体: Chr08 坐标: 49021768-49023132 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004051`
名称	SmilChr08G004051
描述	NADPH-dependent aldehyde reductase 1, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	49021768 - 49023132 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996962`
GeneID	`130996962`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996962`
原始查询	`SmilChr08G004051`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NADPH-dependent aldehyde reductase 1, chloroplastic
产物	NADPH-dependent aldehyde reductase 1%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G54870` (AT1G54870) NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841926] identity=77.4; qcov=0.966; evalue=2e-172; confidence=high
Rice	`Os05g0140800` - identity=69.8; qcov=1.02; evalue=1.91e-148; confidence=high
GO	GO:0016491 (oxidoreductase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00106 (adh_short); PF08659 (KR); PF13561 (adh_short_C2); PF23441 (SDR)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996962

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057778238.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057778238.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057778238.1`
4	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057778238.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778238.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:49022202`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr8:49022275`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr8:49022319`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr8:49022331`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:49022355`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr8:49022356`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr8:49022376`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr8:49022425`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr8:49022439`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,A5,B12,B78,C27
`Chr8:49022463`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr8:49022487`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B33,C59,C83,D5,D8
`Chr8:49022496`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B29,B40,C72,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778238.1

293 aa

146

293

SDR

adh_short

adh_short_C2

PF23441 SDR 37-269 aa PF00106 adh_short 43-237 aa PF08659 KR 45-221 aa PF13561 adh_short_C2 51-288 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778238.1`	Pfam	`PF23441`	SDR	Domain	37	269	2e-12	47.8	SDR-like rossmann domain
`XP_057778238.1`	Pfam	`PF00106`	adh_short	Domain	43	237	4.5e-45	154.3	short chain dehydrogenase
`XP_057778238.1`	Pfam	`PF08659`	KR	Family	45	221	6.2e-07	30.2	KR domain
`XP_057778238.1`	Pfam	`PF13561`	adh_short_C2	Domain	51	288	9.9e-56	189.7	Enoyl-(Acyl carrier protein) reductase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922255.1
CCTCCGCCGCTCTCCACTCCATAAATTATGCTCTTTTCCCCATCTCCTCTCCTTCCCAAATCCACACTCGCAATCTCCTCCATCGCCACGTCACTTTCAAATCTCACTCATCACCAATCACTCCACTCCCCAAGTTTCTGCAGATCCGATCAATGGCTTCCGGCGACAAACAATTCCCACCGCAGAGACAGGATGCTCAGCCAGGAAAAGAGCACCTCATGGACCCCACTCCCCGCGCCGCCACCGCAGACTACAAGCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996962
ATGGCTTCCGGCGACAAACAATTCCCACCGCAGAGACAGGATGCTCAGCCAGGAAAAGAGCACCTCATGGACCCCACTCCCCGCGCCGCCACCGCAGACTACAAGCCAGCTGACAAGCTCGTCGGCAAGGTGGCGCTGGTGACCGGCGGCGACTCCGGGATCGGGCGCGCCGTGGCGCACTGCTTCGCGCTGGAGGGCGCCACGGTGGCCTTCACGTACGTGAAGGGGCAGGAGGACAAGGACGCGAGCGACACGCTCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778238.1
MASGDKQFPPQRQDAQPGKEHLMDPTPRAATADYKPADKLVGKVALVTGGDSGIGRAVAHCFALEGATVAFTYVKGQEDKDASDTLSMLSGAKHRDAKDPVAIPTDLGYDDNCRRVVDEVVNSFGRIDILVNNAAEQYEAGSVEEIDEPRLDRVFRTNIYSYFFTTRHALKHMKEGSSIINTTSVNAYKGNAKLLDYTATKGAIVAFTRGLALQLAQKGIRVNGVAPGPIWTPLIPASFTEEESASFGQQTPMGRAGQPH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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