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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004052`

染色体: Chr08 坐标: 49023975-49026006 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004052`
名称	SmilChr08G004052
描述	putative F-box protein PP2-B12
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	49023975 - 49026006 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996946`
GeneID	`130996946`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996946`
原始查询	`SmilChr08G004052`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative F-box protein PP2-B12
产物	putative F-box protein PP2-B12
Arabidopsis	`AT2G02240` (MEE66) F-box family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814755] identity=47.1; qcov=0.967; evalue=3.46e-87; confidence=high
Rice	`Os02g0813350` (OsFbox120) - identity=44.6; qcov=0.977; evalue=9.83e-77; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF14299 (PP2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996946

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778215.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057778215.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057778215.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778215.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778215.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:49025740`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778215.1

301 aa

150

301

F-box

PP2

PF00646 F-box 11-49 aa PF14299 PP2 107-297 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778215.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	11	49	0.00012	22.5	F-box domain
`XP_057778215.1`	Pfam	`PF14299`	PP2	Family	107	297	6.9e-57	192.3	Phloem protein 2

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922232.1
CAATATATACATCTGGAGCTCCGCCGCGTGTCTATATATGATATAAATATGCAGCGGTGGCCTCGCTAAGTAACTGCACGAAGATACTCGATTTCTAAATATCTAGAGAGAAGAAAGAGAGAGAGAGATATGGCGGTGGAGAGTTCTGATGATATTTACGCTCTCCCAGAGGACTGCATAGCCACCGCGCTGTCGCTCACCAGCCCTAAGGACGCTTGCCGGCTTTCGGCCGTCGCCTCTACATTCCGATCCGCCTCCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996946
ATGGCGGTGGAGAGTTCTGATGATATTTACGCTCTCCCAGAGGACTGCATAGCCACCGCGCTGTCGCTCACCAGCCCTAAGGACGCTTGCCGGCTTTCGGCCGTCGCCTCTACATTCCGATCCGCCTCCCAATCCGACGCCGTTTGGGGCCGCTTTTTGCCCTCCGATTATCGAGACATTATTTCCCGCGCTGTCGACGGCGGCGATTCACTGCTTGCTAAATTTCATTCCAAAAAGGACCTCTATCTCCACCTCTGCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778215.1
MAVESSDDIYALPEDCIATALSLTSPKDACRLSAVASTFRSASQSDAVWGRFLPSDYRDIISRAVDGGDSLLAKFHSKKDLYLHLCDHPIVIEDGRKSFQLEKLSGKKCYMLSARDLYIVWGDTPQYWRFISIPESRFLEVAELLDVCWFEIRGKIKMSMLSSGTNYAAYLVYTCKTRLYGFDHQSADGYVGVSGRESEKRSVCLDPEGVQSQRYQIVPRRVGWFYHRLTQMRNPEAMLPEEETEQPKQRDDGWMEVELG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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