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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004077`

染色体: Chr08 坐标: 49393341-49395215 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004077`
名称	SmilChr08G004077
描述	uncharacterized SmilChr08G004077
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	49393341 - 49395215 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996945`
GeneID	`130996945`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996945`
原始查询	`SmilChr08G004077`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hAT dimerization domain-containing protein / transposase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833333]; symbol=AT5G33406; hit=AT5G33406; species=arabidopsis; confidence=high
产物	hAT dimerization domain-containing protein / transposase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833333]; symbol=AT5G33406; hit=AT5G33406; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G33406` (AT5G33406) hAT dimerization domain-containing protein / transposase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833333] identity=68.4; qcov=0.832; evalue=8.34e-132; confidence=high
Rice	`Os09g0499600` - identity=42.1; qcov=0.984; evalue=2.14e-82; confidence=medium
GO	GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF04937 (DUF659); PF05699 (Dimer_Tnp_hAT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996945

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778214.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057778214.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778214.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778214.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057778214.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:49393610`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C29
`Chr8:49393682`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A25,C59,C61
`Chr8:49393715`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C79
`Chr8:49393715`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C79
`Chr8:49393737`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B90,B93,C2,C39,C45
`Chr8:49393750`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	A16,A4,C1
`Chr8:49393750`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	3	A16,A4,C1
`Chr8:49393763`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,C37,C8
`Chr8:49393787`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B21,B77,C49
`Chr8:49393790`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B98,C48,C64
`Chr8:49393791`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B128,B17
`Chr8:49393795`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778214.1

316 aa

158

316

DUF659

Dimer_Tnp_hAT

PF04937 DUF659 3-37 aa PF05699 Dimer_Tnp_hAT 265-315 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778214.1`	Pfam	`PF04937`	DUF659	Domain	3	37	5.9e-11	42.9	Domain of unknown function (DUF659)
`XP_057778214.1`	Pfam	`PF05699`	Dimer_Tnp_hAT	Domain	265	315	1.1e-09	38.6	hAT family C-terminal dimerisation region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922231.1
CTCCAAGAGGCTCCGTGTTCATCAAATCGGTGGAAGTTTCCGAAGTTGTGAAAGATGCACAAACGTTGTTTAAAATGCTTGATGCCATTGTTGAGGAAGTTGGAGAGGAAAATGTTGTGCAAGTGGTGACGGATAATGCTTCTAACTATGTTAAAGCGGGTAAGTAGTTTAAATCATCTTTAATTTAAACTTTCAATTTATGTTTTCTTAATGATTAAAGCTTAATCTTTATGAATAGGGAAATTTCTTATGCTTGAAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996945
ATGCTTGAAAGACCACATCTCTATTGGACTCCATGTGCCACACATTGTGTGGACTTGATGTTGGAGGATATTGGAAAGCTTCCAATGATTAAGAATGCTATCAAGAAGGCAATCTACATGAATGGTTATATATATAACCATGTCGCCGTTGTGAACATGATGAGGAGATTCACCAATCAAAGGAATTTGCATCGACCGGCGGTCACAAGATTTGCAACTTCCTTTATCACTCTTGCACAATATCACAAGCAAAAAAACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778214.1
MLERPHLYWTPCATHCVDLMLEDIGKLPMIKNAIKKAIYMNGYIYNHVAVVNMMRRFTNQRNLHRPAVTRFATSFITLAQYHKQKNNLRKMVTSEEWIASKWQKDAGGRKMTSIILQDTFWRNVLYALKLVGPLVKVLRMVDGDKKPAMGYIYEATDRAKEAIAKSFGHKEERYKEAFEIIDKRWDCQLHRPLHAAGYFLNPEIYYDNPEGVSCQEVEKGLYESIQRLVRDEATQDKIMVELDAYKNATGLFGNAMTIRH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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