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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004081`

染色体: Chr08 坐标: 49431419-49433442 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004081`
名称	SmilChr08G004081
描述	putative F-box protein PP2-B12
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	49431419 - 49433442 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996942`
GeneID	`130996942`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996942`
原始查询	`SmilChr08G004081`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative F-box protein PP2-B12
产物	putative F-box protein PP2-B12
Arabidopsis	`AT2G02240` (MEE66) F-box family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814755] identity=44; qcov=0.991; evalue=4.33e-87; confidence=medium
Rice	`Os02g0813350` (OsFbox120) - identity=44.6; qcov=0.896; evalue=3.34e-76; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF14299 (PP2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996942

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778210.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057778210.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057778210.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778210.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778210.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:49431731`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr8:49431765`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B10,B139,B62,B94
`Chr8:49431800`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr8:49431818`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr8:49431833`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B130,B6,B62
`Chr8:49431845`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,C80
`Chr8:49432007`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B100,C64,C66,C67
`Chr8:49432061`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,B121,C80
`Chr8:49433315`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C2
`Chr8:49433315`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C2
`Chr8:49433320`	`T`	`TCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B29
`Chr8:49433320`	`T`	`TCC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B29

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778210.1

328 aa

164

328

F-box

PP2

PF00646 F-box 38-76 aa PF14299 PP2 134-324 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778210.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	38	76	0.00014	22.4	F-box domain
`XP_057778210.1`	Pfam	`PF14299`	PP2	Family	134	324	8.5e-57	192.0	Phloem protein 2

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922227.1
AATATATACATCTGGAGCTCCGCCGCGTGTCTATATATGATATAAATATGCAGCGGTGGCCTCGCCAAGTAACTGCACGAAGATACTCGATTTCTAAATATCTAGAGAGAAGAAAGAGAGAGAGAGATATGGCGGTGGAGAGTTCTGATGATATTTACGCTCTCCCAGAGGACTGCATAGCCACCGCGCTGTCGCTCACCAGCCCTAAGGACGCTTGCCGGCTTTCGGCCGTCGCCTCTACATTCCGATCCGCCTCCCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996942
ATGCAGCGGTGGCCTCGCCAAGTAACTGCACGAAGATACTCGATTTCTAAATATCTAGAGAGAAGAAAGAGAGAGAGAGATATGGCGGTGGAGAGTTCTGATGATATTTACGCTCTCCCAGAGGACTGCATAGCCACCGCGCTGTCGCTCACCAGCCCTAAGGACGCTTGCCGGCTTTCGGCCGTCGCCTCTACATTCCGATCCGCCTCCCAATCCGACGCCGTTTGGGGCCGCTTTTTGCCCTCCGATTATCGAGACAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778210.1
MQRWPRQVTARRYSISKYLERRKRERDMAVESSDDIYALPEDCIATALSLTSPKDACRLSAVASTFRSASQSDAVWGRFLPSDYRDIISRAVDGGDSLLAKFHSKKDLYLHLCDHPIVIEDGRKSFQLEKLSGKKCYMLSARDLYIVWGDTPQYWRFISIPESRFLEVAELLDVCWFEIRGKIKMSMLSSGTNYAAYLVYTCKTRLYGFDHQSADGYVGVSGRESEKRSVCLDPEGVQSQRYQIVPRRVGWFYHRLTQMR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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