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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004086`

染色体: Chr08 坐标: 49550184-49554487 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004086`
名称	SmilChr08G004086
描述	aspartyl protease family protein 1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	49550184 - 49554487 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996930`
GeneID	`130996930`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996930`
原始查询	`SmilChr08G004086`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aspartyl protease family protein 1-like
产物	aspartyl protease family protein 1-like
Arabidopsis	`AT2G17760` (AT2G17760) Eukaryotic aspartyl protease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816285] identity=52.21; qcov=0.94; evalue=4.9e-173; confidence=high
Rice	`Os04g0228000` - identity=48.08; qcov=0.853; evalue=5.64e-139; confidence=high
GO	GO:0004190 (aspartic-type endopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00026 (Asp); PF14541 (TAXi_C); PF14543 (TAXi_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996930

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057778188.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057778188.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:49552221`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr8:49552324`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B51
`Chr8:49552345`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B120
`Chr8:49552345`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B120
`Chr8:49553165`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778188.1

529 aa

264

529

Asp

TAXi_N

TAXi_C

PF00026 Asp 101-438 aa PF14543 TAXi_N 103-280 aa PF14541 TAXi_C 300-440 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778188.1`	Pfam	`PF00026`	Asp	Domain	101	438	2.2e-21	77.3	Eukaryotic aspartyl protease
`XP_057778188.1`	Pfam	`PF14543`	TAXi_N	Domain	103	280	1.4e-32	114.0	Xylanase inhibitor N-terminal
`XP_057778188.1`	Pfam	`PF14541`	TAXi_C	Domain	300	440	3.2e-16	60.3	Xylanase inhibitor C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922205.1
AAATTTGAAGTAGAAAATTGCAGCAAAGGAAGGTTCTTGGTTGTGAATATAGCGGCAGCTGCGGCGGGCCCCACAAACAACTGCCACATCTCCGCCACGCCTACAATTCTACCAACTGTTTTAAACTAAGCATGAAGATAGTCGTGTTGCCGTCGACTTTCTTTTTCCATCAATTTCCTATTTTCTCGATTCATGCTACTAAATACATTATGATGATGGTGATGATGATGATGGCCGCGTTTTCTTCTTCCTCTTCTCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080394.1_cds_XP_057778188.1_45255
ATGTTTTTTAAGGATTTTTTGCTGATTCTGTTTGTGTGCTGGATTAATTTTGGGGGCAGCGATGCCTACGGCCTCTTCGGCTTCGATGTCCACCACCGCTATTCCGATACCGTTAAGGATTTCCTCGACGTCAGGGGGCTGCCGGAGAAGGACAGTCTCGACTTCTTCGCCGCCATGGCCCACCGCGACCATCTCTCCAAAGCCCGCCGCCTCGCCACCACCCCGGCCTCCAGCCCCTACCTCACCTTCTTCGGCTCCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778188.1
MFFKDFLLILFVCWINFGGSDAYGLFGFDVHHRYSDTVKDFLDVRGLPEKDSLDFFAAMAHRDHLSKARRLATTPASSPYLTFFGSNETYRLSSLGFLHYSLVSVGTPPVSFLVALDTGSDLFWLPCDCTDCVRSLNSTSGKTVELSIYNPNVSSTSLPVPCNSTMCGRTRGCALRRKACAYQEVYLSSNTSSTGILVDDVLHLGTYESPQKPVSAPITLGCGIIQTGDFLDGAAINGLFGLGMDNISVPSILANKGLAA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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