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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004093`

染色体: Chr08 坐标: 49618629-49620557 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004093`
名称	SmilChr08G004093
描述	uncharacterized SmilChr08G004093
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	49618629 - 49620557 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998608`
GeneID	`130998608`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998608`
原始查询	`SmilChr08G004093`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0656500; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os11g0656500; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT4G23160` (CRK8) cysteine-rich RECEPTOR-like kinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828415] identity=41.3; qcov=0.215; evalue=2.9e-26; confidence=weak
Rice	`Os11g0656500` - identity=45.3; qcov=0.248; evalue=5.15e-34; confidence=weak
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding)
KEGG	-
Pfam	PF07727 (RVT_2); PF13976 (gag_pre-integrs)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998608

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057780005.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057780005.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780005.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780005.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057780005.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:49618630`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	A18,D4
`Chr8:49618630`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	A18,D4
`Chr8:49618635`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B104,B119,B134,B87
`Chr8:49618637`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr8:49618641`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B18,B4,C47
`Chr8:49618646`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B113,B51,B52,C10,C16,C49,C73
`Chr8:49618664`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr8:49618666`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,C71
`Chr8:49618668`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B26,C13,C17
`Chr8:49618687`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B57,B58,B79,C2,C43
`Chr8:49618700`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,B40
`Chr8:49618706`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B57,B58

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780005.1

642 aa

321

642

gag_pre-integrs

RVT_2

PF13976 gag_pre-integrs 162-222 aa PF07727 RVT_2 538-642 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780005.1`	Pfam	`PF13976`	gag_pre-integrs	Domain	162	222	8.4e-09	35.8	GAG-pre-integrase domain
`XP_057780005.1`	Pfam	`PF07727`	RVT_2	Domain	538	642	1.7e-30	107.1	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924022.1
ATGGATAATGTTAATAACATAGGATTTTCACATGAAAAGAAATCAAAGTGGAAGTCTAAGTCCCATGCGTGTCATTATTGCTCAACTCCATATCACATTAAACCCTACTGTGTTAAATGTCTCAGTGATGTTGATGATCTATCTGCCAAACAGACGTTTGATAGTTTCCAGAGGAATGTTAGTAACATTAGCAGGTTTGATTTTGGAGAAATGTCCAACACTGAAAAAGATGACGAACCTTGCAATGTTATATACATATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998608
ATGGATAATGTTAATAACATAGGATTTTCACATGAAAAGAAATCAAAGTGGAAGTCTAAGTCCCATGCGTGTCATTATTGCTCAACTCCATATCACATTAAACCCTACTGTGTTAAATGTCTCAGTGATGTTGATGATCTATCTGCCAAACAGACGTTTGATAGTTTCCAGAGGAATGTTAGTAACATTAGCAGGTTTGATTTTGGAGAAATGTCCAACACTGAAAAAGATGACGAACCTTGCAATGTTATATACATATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780005.1
MDNVNNIGFSHEKKSKWKSKSHACHYCSTPYHIKPYCVKCLSDVDDLSAKQTFDSFQRNVSNISRFDFGEMSNTEKDDEPCNVIYIFLHTNISDCWYFDSGCSRYMTGSKALLTDYVSTNGGNITFRAGMLVKFDKNICEVFDNINQCVMMCRTSSNICYKSENGNICNVVKLSNVELQHQRLNHVNLKNFKKLIANDVVRGLPKFVIKRDVACQPCQKGQQLRTAYPMLSTCNTTRCLELLHRNLMSHVEVESLGGERY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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