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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004121`

染色体: Chr08 坐标: 50052362-50056732 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004121`
名称	SmilChr08G004121
描述	aspartic proteinase 36-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	50052362 - 50056732 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998870`
GeneID	`130998870`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998870`
原始查询	`SmilChr08G004121`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aspartic proteinase 36-like
产物	aspartic proteinase 36-like
Arabidopsis	`AT5G43100` (AT5G43100) Eukaryotic aspartyl protease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834326] identity=64.2; qcov=0.889; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0592200` (OsAP65) - identity=70.9; qcov=0.865; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004190 (aspartic-type endopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00026 (Asp); PF14541 (TAXi_C); PF14543 (TAXi_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998870

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057780276.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057780276.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780276.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780276.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780276.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:50052618`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:50052619`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B76,C2,D5
`Chr8:50052641`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C16,C39
`Chr8:50052641`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C16,C39
`Chr8:50052736`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr8:50052737`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B35,C22,D2
`Chr8:50052773`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr8:50052792`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B134,B37,B61,B74
`Chr8:50052792`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B134,B37,B61,B74
`Chr8:50052794`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	22	A5,B113,B120,B124,B137,B138,B42,B43,B44,B48,B5,C16,C35,C4,C45,C48,C53,C54,C64,C66,C70,D4
`Chr8:50052799`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B134,B37,B61,B74
`Chr8:50052803`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B134,B37,B61,B74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780276.1

497 aa

248

497

TAXi_N

Asp

TAXi_C

PF14543 TAXi_N 90-254 aa PF00026 Asp 90-428 aa PF14541 TAXi_C 274-428 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780276.1`	Pfam	`PF14543`	TAXi_N	Domain	90	254	6.6e-36	124.8	Xylanase inhibitor N-terminal
`XP_057780276.1`	Pfam	`PF00026`	Asp	Domain	90	428	8e-34	118.2	Eukaryotic aspartyl protease
`XP_057780276.1`	Pfam	`PF14541`	TAXi_C	Domain	274	428	1.5e-28	100.3	Xylanase inhibitor C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924293.1
GGCCATTGACTTGCAAAGTAAAAAAAAACATTCAAAGTCAACTTGAGAAAAAAATAAATATATATATATATATATATATATAGATTAGAGAAAATCTCTTCTACATCACACCGGGATCTCTTACTCTCTTCCTCGGCCACCGCAACACCGGTGCAGCGCAATCGATCATCGTTAAGAAATGGGTTGGCTACTGACTCTCGCCATCCTCTTCTTCGCCACCGCCGTCTCCGCCGCTGTATCTCGATCGAATTCTCCGCATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998870
ATGGGTTGGCTACTGACTCTCGCCATCCTCTTCTTCGCCACCGCCGTCTCCGCCGCTGTATCTCGATCGAATTCTCCGCATCTCCATTCGATTGCATTCGTCAATAACACGAGCAGTAGAGGCAACACCATGATCTTGCCCCTGTTTCTCAAGCAGCGCAACAGCCACCGCCTCAATGAGGACTTTTTCTCCCGTCGCCATCTCCACTCGCGCACCACTCCCAACGCTCGCATGCCTCTCCATGACGATCTCCTCCGCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780276.1
MGWLLTLAILFFATAVSAAVSRSNSPHLHSIAFVNNTSSRGNTMILPLFLKQRNSHRLNEDFFSRRHLHSRTTPNARMPLHDDLLRNGYYTTRLWIGTPPQMFALIVDTGSTVTYVPCSTCEQCGMHQDPRFQPDLSSTYKPLKCNTHCTCDADREQCIYERQYAEMSSSSGVLGVDIISFGNQSDLEPQRATFGCENMETGDLYSQHADGIMGLGRGDISIMDQLVEKGVINDSFSLCYGGMDVGGGSMVLGGISPPSE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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