当前解析结果
SmilChr08G004135| 统一新 Gene ID | SmilChr08G004135 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G004135 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G004135 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 50286140 - 50287492 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130998616 |
|---|---|
| GeneID | 130998616 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130998616 |
| 原始查询 | SmilChr08G004135 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=weak |
| 产物 | hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=weak |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os12g0292200- identity=29.8; qcov=0.209; evalue=1.27e-06; confidence=weak |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130998616 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057780012.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057780012.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057780012.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057780012.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057780012.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:50286200 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C39,C55 |
Chr8:50286242 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D6 |
Chr8:50286269 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A19,B25,C82,D2 |
Chr8:50286347 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B111,C20 |
Chr8:50286359 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B105 |
Chr8:50286362 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B105 |
Chr8:50286422 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A21,B43 |
Chr8:50286425 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A23,C1,C35,C39 |
Chr8:50286449 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B8,C5 |
Chr8:50286477 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B106,B16,D1,D11,D2 |
Chr8:50286494 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A20,C25 |
Chr8:50286527 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A20,A4,B134 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。