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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004136`

染色体: Chr08 坐标: 50358973-50360040 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004136`
名称	SmilChr08G004136
描述	uncharacterized SmilChr08G004136
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	50358973 - 50360040 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998617`
GeneID	`130998617`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998617`
原始查询	`SmilChr08G004136`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=46.5; qcov=0.322; evalue=4.96e-22; confidence=low
Rice	`Os06g0597250` - identity=55; qcov=0.824; evalue=1.84e-85; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998617

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057780013.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780013.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780013.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057780013.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057780013.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:50359023`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C18,C9
`Chr8:50359364`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,B30,D6
`Chr8:50359368`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C6
`Chr8:50359368`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C6
`Chr8:50359384`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	A20,B102,B3,B96,C74
`Chr8:50359384`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B102,B3,B96,C74
`Chr8:50359432`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B110,C47
`Chr8:50359470`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B124,B21,B25,B45,C17
`Chr8:50359481`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	B109,B43,B48,C13,C14,C43,D1
`Chr8:50359490`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	135	A10,A14,A19,A20,A21,A24,A25,A4,A5,A7,A8,B1,B108,B11,B111,B112,B114,B115,B117,B119,B12,B121,B126,B128,B130,B131,B133,B134,B135,B136,B137,B138,B139,B140,B16,B17,B19,B20,B22,B25,B26,B27,B29,B32,B33,B34,B37,B40,B44,B45,B46,B47,B48,B49,B50,B51,B52,B53,B54,B55,B58,B60,B61,B63,B64,B65,B67,B68,B69,B70,B71,B73,B75,B8,B80,B81,B84,B85,B87,B88,B89,B90,B94,B97,C1,C15,C17,C18,C22,C26,C27,C28,C29,C3,C32,C33,C34,C35,C36,C38,C39,C44,C47,C48,C51,C53,C54,C55,C56,C57,C62,C64,C65,C66,C67,C68,C7,C70,C72,C73,C74,C75,C78,C79,C8,C80,C84,C85,C86,C87,C9,D10,D4,D5,D8
`Chr8:50359519`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B64,C25
`Chr8:50359520`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,B21

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780013.1

267 aa

134

267

Plant_tran

PF04827 Plant_tran 97-236 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780013.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	97	236	1.5e-69	234.5	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924030.1
ATGCAGCCAAGATTCGAGATCCCATTTGTCTCTTTGAAGAACTCTTCGGACTCAAGTTCTGATGAAATCAAATTCCAACAGCCAACAGGAGATATTGTGATAGGGAACAGACGAGATGCCACCGGCAGAATAGGTCTTTCATCATTGCAGAAATGTACTGGAGCCATGAGGGTATTGGCATATGGCACATCTTCCGATGTTGTCGATGAGTATCTACGAATGAGTTCATCTTCCACAAGAGATGCTTTAGTTCATTTTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998617
ATGCAGCCAAGATTCGAGATCCCATTTGTCTCTTTGAAGAACTCTTCGGACTCAAGTTCTGATGAAATCAAATTCCAACAGCCAACAGGAGATATTGTGATAGGGAACAGACGAGATGCCACCGGCAGAATAGGTCTTTCATCATTGCAGAAATGTACTGGAGCCATGAGGGTATTGGCATATGGCACATCTTCCGATGTTGTCGATGAGTATCTACGAATGAGTTCATCTTCCACAAGAGATGCTTTAGTTCATTTTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780013.1
MQPRFEIPFVSLKNSSDSSSDEIKFQQPTGDIVIGNRRDATGRIGLSSLQKCTGAMRVLAYGTSSDVVDEYLRMSSSSTRDALVHFVEGVISCFGGTYLRRPNEQDLARLLYVGEQRGFPGMIGSIDCMHWEWKNCPNAWAGQYTGRSEKPTIILEVVASYDLWIWHAFFGTPGSCNDINVLHRSPVFNDVLEGRTPKVNYVVNGRHYDRAYYLTDGIYPSWAVFVKSISCSLNTKSLSEKMLSEHLEFYKLDLHFYDAH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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