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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004145`

染色体: Chr08 坐标: 50548742-50552919 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004145`
名称	SmilChr08G004145
描述	sodium/pyruvate cotransporter BASS2, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	50548742 - 50552919 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998889`
GeneID	`130998889`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998889`
原始查询	`SmilChr08G004145`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	sodium/pyruvate cotransporter BASS2, chloroplastic-like
产物	sodium/pyruvate cotransporter BASS2%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT1G78560` (AT1G78560) Sodium Bile acid symporter family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844192] identity=38.7; qcov=0.946; evalue=9.47e-73; confidence=medium
Rice	`Os12g0170300` - identity=67.5; qcov=0.829; evalue=3.72e-152; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF01758 (SBF); PF13593 (SBF_like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998889

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057780299.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057780299.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780299.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780299.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780299.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:50549016`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B109,B114,C15
`Chr8:50549045`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:50549071`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B109,B114,C15
`Chr8:50549093`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,C15
`Chr8:50549144`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr8:50549658`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	34	A1,A13,A9,B109,B114,B117,B129,B18,B29,B30,B37,B42,B43,B63,B72,B75,B8,B87,B90,B92,B98,C15,C31,C37,C42,C45,C50,C51,C57,C7,C87,D11,D3,D4
`Chr8:50550597`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr8:50550688`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,B49,C32,C68
`Chr8:50550938`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B113,B51,B52,C10
`Chr8:50551156`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B109,B114,C15
`Chr8:50551157`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr8:50552498`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B91

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780299.1

404 aa

202

404

SBF_like

SBF

PF13593 SBF_like 99-363 aa PF01758 SBF 103-279 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780299.1`	Pfam	`PF13593`	SBF_like	Domain	99	363	1.1e-15	58.5	SBF-like CPA transporter family (DUF4137)
`XP_057780299.1`	Pfam	`PF01758`	SBF	Family	103	279	1.9e-41	142.6	Sodium Bile acid symporter family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924316.1
GCGACTGCAATTAACTCTTAAAATTATTATCAAAATTTACAATGAATTAGTAATTCAGAAAATATATTATGCCGCTAATATCGACAGATTTACGAGGGAAGAATATTCGGCGGCTCGCCTGAATCAAATAGATCAACAAAACAGAGCATCCGCCGCCGCTGCCGCCGCAATGGCGATCGCTCTCTGCTTCACCCCATTATTCTGCCACCACAAACAACTCATCCCTCCAAAAATCCCACTCTACAAACCCTTCACTAACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998889
ATGGCGATCGCTCTCTGCTTCACCCCATTATTCTGCCACCACAAACAACTCATCCCTCCAAAAATCCCACTCTACAAACCCTTCACTAACCCCATCGCCATTTCCGCCAGATATTCCACCGCTGCTAGATTTTGCGTTAATCAAATTCATGAAAATTCAGCTGCAGATAAGCCCAGATGGGAGGAGTGGCTGGCCGCTGCTGCCAGCTTGTACCCTCTTTACGTGACGGTTGGCGGAGTGGTTGCTTTCGTCAGACCCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780299.1
MAIALCFTPLFCHHKQLIPPKIPLYKPFTNPIAISARYSTAARFCVNQIHENSAADKPRWEEWLAAAASLYPLYVTVGGVVAFVRPSTFSWFVNMAPNSYSFTLGLIMLSMGITLEFKELIDLFRQRPFSILYGCAAQYTIMPSFGWIVSKLLGLSPSLSVGLILLSCCPGGTASNVVTLIAQGDVPLSIVMTVCTTLGAVILTPLLTKIIAGTFVPVNAASLSMSTLQVVVAPILLGSYLQSTFPEVVKLLTPFSPLVA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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