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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004153`

染色体: Chr08 坐标: 50704961-50708653 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004153`
名称	SmilChr08G004153
描述	nifU-like protein 2, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	50704961 - 50708653 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998894`
GeneID	`130998894`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998894`
原始查询	`SmilChr08G004153`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nifU-like protein 2, chloroplastic
产物	nifU-like protein 2%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT5G49940` (NFU2) NIFU-like protein 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835057] identity=80.7; qcov=0.724; evalue=1.75e-101; confidence=high
Rice	`Os11g0181500` (OsISC12) - identity=77.8; qcov=0.74; evalue=1.47e-100; confidence=high
GO	GO:0005506 (iron ion binding); GO:0005739 (mitochondrion); GO:0009570 (chloroplast stroma); GO:0016226 (iron-sulfur cluster assembly); GO:0051536 (iron-sulfur cluster binding)
KEGG	-
Pfam	PF01106 (NifU)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998894

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057780307.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057780307.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780307.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780307.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780307.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:50705504`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr8:50706302`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr8:50706424`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr8:50706432`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780307.1

250 aa

125

250

NifU

PF01106 NifU 104-169 aa PF01106 NifU 185-246 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780307.1`	Pfam	`PF01106`	NifU	Family	104	169	2.6e-42	143.5	NifU-like domain
`XP_057780307.1`	Pfam	`PF01106`	NifU	Family	185	246	2.6e-42	143.5	NifU-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924324.1
TAAAGTCAAGTTACAAATTAAGTATAATGTAAACCTGGTTTTAGTCAAATTACAAATTGAATACTACTAACTAATTTTGTATATCAAATAAAATCAAATAGTCAAAAGAGGACAAAAGAAAAGCCCAAATAAAAAACAGAGATGAAGAAAAACTAACCAGAAGTTGTTCTCCGTTTGGCTTTTGCAAAACTCTCTGAAGCTCCATCGATTCCGATGCATGCGGCCATGGCGGTTACTTCTCCCTCCGCCCCCTATGCTTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998894
ATGCATGCGGCCATGGCGGTTACTTCTCCCTCCGCCCCCTATGCTTACAACTGCAGGCTTCACCAAACCCTAGAGTCCTCCTGTTCTCCTTCCTCCTCCGCCTCTGCCCCCACCCTCTCCCGCCGCCCCTTTTCACCTAAGGTATCGAGCTTCTTCGGCGCTCGGATTTCGGTTACCGTTAGACTCAATCAGGCGCTGGCGCCCTCATCACATCAGCTGCGGCGTAGCTCGCGCTCAACTTGTCGTCCAGGAATAAAGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780307.1
MHAAMAVTSPSAPYAYNCRLHQTLESSCSPSSSASAPTLSRRPFSPKVSSFFGARISVTVRLNQALAPSSHQLRRSSRSTCRPGIKAVATPDSAVELPLTAENVESVLDEIRPYLIADGGNVALHEIDGNVVKLKLQGACGSCPSSVVTMKMGIERRLMEKIPEVIAVESIPDEETGLELNEENIEKVLEEIRPYLIGAAGGDLELVEIEEPIVKVRISGPAAGVMTVRVAVTQKLREKIPSIAAVQLLS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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