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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004157`

染色体: Chr08 坐标: 50800171-50806894 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004157`
名称	SmilChr08G004157
描述	probable magnesium transporter NIPA4
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	50800171 - 50806894 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998896`
GeneID	`130998896`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998896`
原始查询	`SmilChr08G004157`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable magnesium transporter NIPA4
产物	probable magnesium transporter NIPA4
Arabidopsis	`AT1G71900` (AT1G71900) magnesium transporter, putative (DUF803) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843521] identity=81.3; qcov=0.971; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0882300` - identity=83.2; qcov=0.942; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0015095 (magnesium ion transmembrane transporter activity); GO:0015693 (magnesium ion transport); GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF05653 (Mg_trans_NIPA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998896

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole membrane	液泡膜	1.00000	`XP_057780309.1`
2	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057780309.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780309.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780309.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780309.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:50804871`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780309.1

384 aa

192

384

Mg_trans_NIPA

PF05653 Mg_trans_NIPA 21-204 aa PF05653 Mg_trans_NIPA 240-350 aa

XP_057780311.1

347 aa

174

347

Mg_trans_NIPA

PF05653 Mg_trans_NIPA 21-313 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780309.1`	Pfam	`PF05653`	Mg_trans_NIPA	Family	21	204	9e-128	426.3	Magnesium transporter NIPA
`XP_057780309.1`	Pfam	`PF05653`	Mg_trans_NIPA	Family	240	350	9e-128	426.3	Magnesium transporter NIPA
`XP_057780311.1`	Pfam	`PF05653`	Mg_trans_NIPA	Family	21	313	4.3e-135	450.3	Magnesium transporter NIPA

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924328.1
ATAATCGAAAATTATCGTGGATATTGCTTTCTTGACAAGGTTGGCCACTTCTGCTTCACTGTATTTTTTCCCCCTTTTTTTTCTTTCTTTTTGGTTTTGCTTTATTAAAAAATTATCACATCAAAACCTCAGTCGAGGAGAAGTCTAAAACTGTTCACTGATAATTTCACCTTCTTTCTCCCCTAACTCCGATCTGAAATTGTAAAATTCCCCCATTTCTCATCACCCGCGTCGCTGCCTGTCGAAGATTATCCAATAGT...

XM_057924326.1
TCACTGTATTTTTTCCCCCTTTTTTTTCTTTCTTTTTGGTTTTGCTTTATTAAAAAATTATCACATCAAAACCTCAGTCGAGGAGAAGTCTAAAACTGTTCACTGATAATTTCACCTTCTTTCTCCCCTAACTCCGATCTGAAATTGTAAAATTCCCCCATTTCTCATCACCCGCGTCGCTGCCTGTCGAAGATTATCCAATAGTTAGCTACGGCCGCCGGCAATTGCAGATCTTCCGCACAGAAATTGGAACCCTATAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130998896
ATGGCGTCCGAGCAGGCGGCTACGGATGCCATGTCGGATTCGTATCGGGGGATGTCGTCCGACAATATAAAGGGGTTGGTTTTGGCGCTGTCTTCCAGTTTCTTCATCGGCGCCAGCTTCATTGTTAAGAAAAAGGGGTTGAAGAAAGCCGGGGCGTCCGGCGTCAGAGCTGGTGTTGGAGGGTATTCATATCTATACGAGCCATTATGGTGGACTGGCATGATAACGATGATAGTTGGAGAAATTGCAAATTTTGCGGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057780309.1
MASEQAATDAMSDSYRGMSSDNIKGLVLALSSSFFIGASFIVKKKGLKKAGASGVRAGVGGYSYLYEPLWWTGMITMIVGEIANFAAYAFAPAILVTPLGALSIIISAVLAHVILRERLHIFGILGCALCVVGSTTIVLHAPQEREIESVKEVWDLATEPAFVFYAALVIAIVVVLIWHYVPQYGQTHIWFYIGVCSLVGSLSVGVTFLVLLDPAYMKNYNGDYFSVLNECSNYVKFPWQVMSVKALGIALKLTLSGTNQ...

XP_057780311.1
MASEQAATDAMSDSYRGMSSDNIKGLVLALSSSFFIGASFIVKKKGLKKAGASGVRAGVGGYSYLYEPLWWTGMITMIVGEIANFAAYAFAPAILVTPLGALSIIISAVLAHVILRERLHIFGILGCALCVVGSTTIVLHAPQEREIESVKEVWDLATEPAFVFYAALVIAIVVVLIWHYVPQYGQTHIWFYIGVCSLVGSLSVMSVKALGIALKLTLSGTNQLTYPQTWVFAMIVLSCVLTQMNYLNKALDTFNTAVVS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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