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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004168`

染色体: Chr08 坐标: 50990790-50993020 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004168`
名称	SmilChr08G004168
描述	noscapine synthase SDR1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	50990790 - 50993020 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998904`
GeneID	`130998904`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998904`
原始查询	`SmilChr08G004168`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	noscapine synthase SDR1-like
产物	noscapine synthase SDR1-like
Arabidopsis	`AT2G45400` (BEN1) NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819146] identity=34.4; qcov=1.01; evalue=1.92e-47; confidence=low
Rice	`Os06g0651100` - identity=44.5; qcov=1.03; evalue=8.05e-93; confidence=medium
GO	GO:0016616 (oxidoreductase activity, acting on the CH-OH group of donors, NAD or NADP as acceptor)
KEGG	-
Pfam	PF01073 (3Beta_HSD); PF01370 (Epimerase); PF05368 (NmrA); PF07993 (NAD_binding_4); PF13460 (NAD_binding_10); PF16363 (GDP_Man_Dehyd)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998904

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057780326.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057780326.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057780326.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780326.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780326.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:50991114`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,B26,C75,C77
`Chr8:50991303`	`A`	`AAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	11	A5,B119,B23,B42,B43,B5,B93,C19,C45,C58,C85
`Chr8:50991340`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B101,B26,B97,C18
`Chr8:50991414`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:50991451`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A25,B37,C31,C65
`Chr8:50991472`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B114,C15,D10
`Chr8:50991585`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr8:50992291`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A25,B37,C31,C65
`Chr8:50992634`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780326.1

328 aa

164

328

NmrA

Epimerase

GDP_Man_Dehyd

3Beta_HSD

NAD_binding_4

NAD_binding_10

PF05368 NmrA 6-126 aa PF01370 Epimerase 7-251 aa PF16363 GDP_Man_Dehyd 9-84 aa PF01073 3Beta_HSD 9-181 aa PF07993 NAD_binding_4 9-196 aa PF13460 NAD_binding_10 11-134 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780326.1`	Pfam	`PF05368`	NmrA	Family	6	126	5.2e-09	36.8	NmrA-like family
`XP_057780326.1`	Pfam	`PF01370`	Epimerase	Family	7	251	3.8e-23	82.9	NAD dependent epimerase/dehydratase family
`XP_057780326.1`	Pfam	`PF16363`	GDP_Man_Dehyd	Domain	9	84	4.7e-09	36.9	GDP-mannose 4,6 dehydratase
`XP_057780326.1`	Pfam	`PF01073`	3Beta_HSD	Family	9	181	8.8e-16	58.5	3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family
`XP_057780326.1`	Pfam	`PF07993`	NAD_binding_4	Family	9	196	7.8e-10	39.1	Male sterility protein
`XP_057780326.1`	Pfam	`PF13460`	NAD_binding_10	Domain	11	134	9.3e-10	39.4	NAD(P)H-binding

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924343.1
ATACACACACAAATATGAATAAGCAAATGAAGAGCATACACACACACACACACACACACATATATATATATATATATATATATATATATTGAACTAAATTTCGTCAAAGAAATAAAAATCAAGTAATGGAGAAGAGTGTGAAGGTGTGTGTAACTGGAGGTGCAGGTTACATTGCCTCTTTTCTCATCAAGCATCTCTTAGAGAGAGGCTACACTGTTCATGCCACTCTTCGAAGTTTGAACGATGCTTCAAAAGTGGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998904
ATGGAGAAGAGTGTGAAGGTGTGTGTAACTGGAGGTGCAGGTTACATTGCCTCTTTTCTCATCAAGCATCTCTTAGAGAGAGGCTACACTGTTCATGCCACTCTTCGAAGTTTGAACGATGCTTCAAAAGTGGGACTATTGAAAGGGCTTGATCATGCAGAAACAAGATTGAAATTGTTTGAAGGTGATATATATAATCCTACTGAATTTGCAGCTGCTATTCATGGCTGTGAGTTTGTGTTTCACGTAGCTACGCCAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780326.1
MEKSVKVCVTGGAGYIASFLIKHLLERGYTVHATLRSLNDASKVGLLKGLDHAETRLKLFEGDIYNPTEFAAAIHGCEFVFHVATPMQHEGGKYKSTSEAAVAGVKIIAESCIESKMVKRLIYTASVMAASPLKSDASGYEDAIDESCWTPLNLFYEMHSDYIYSKTLAEKEVLSYNGLGIEVVSLACGLVGGETIQSLVPGSMRTLISQALSDETLYKGLRALEDLDSKVPIAHVQDVIDAHIFAMENSNMNGRFLVAS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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