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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004181`

染色体: Chr08 坐标: 51239210-51242008 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004181`
名称	SmilChr08G004181
描述	uncharacterized SmilChr08G004181
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	51239210 - 51242008 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998633`
GeneID	`130998633`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998633`
原始查询	`SmilChr08G004181`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G24255` (AT3G24255) RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822013] identity=27; qcov=0.469; evalue=7.98e-36; confidence=low
Rice	`Os06g0484800` - identity=30.2; qcov=0.696; evalue=5.25e-88; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1); PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998633

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057780029.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057780029.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057780029.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780029.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780029.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:51239245`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B61,C9
`Chr8:51239289`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	16	A19,A23,B113,B122,B134,B137,B45,B47,C25,C34,C53,C56,C63,C65,C67,C79
`Chr8:51239290`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A4,B49,B50
`Chr8:51239290`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A4,B49,B50
`Chr8:51239292`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A4,B49,B50
`Chr8:51239292`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A4,B49,B50
`Chr8:51239336`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,C61
`Chr8:51239343`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,C61
`Chr8:51239360`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B49,B59,C61
`Chr8:51239362`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,B49
`Chr8:51239381`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B49,B59,C61
`Chr8:51239396`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B49,B59,C61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780029.1

932 aa

466

932

RVT_1

zf-RVT

PF00078 RVT_1 272-530 aa PF13966 zf-RVT 788-869 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780029.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	272	530	2.9e-29	103.1	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)
`XP_057780029.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	788	869	2.6e-13	51.1	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924046.1
ATGGAGAGAGCTGCTGTGAAACGTATGCCCTTTAAATTCCTTAATATGTGGCTGGTTCATCAAGACTTTCGAGAGTTTGTGAAAACTTCATGGCATGCGGATATAAGCATTACTTGCCCTCTTCTGAAGGTTATGGTGAAACTGAAAAGGCTGAGATCGAGTCTTAAAGGTTGGAATAAAGAGGTTTTTGGCCATGTGGATGTGGATATTAATCAGCTTCAGATCGATTTGGAAAGGACTCAGAAACGTATCTTGGCTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998633
ATGGAGAGAGCTGCTGTGAAACGTATGCCCTTTAAATTCCTTAATATGTGGCTGGTTCATCAAGACTTTCGAGAGTTTGTGAAAACTTCATGGCATGCGGATATAAGCATTACTTGCCCTCTTCTGAAGGTTATGGTGAAACTGAAAAGGCTGAGATCGAGTCTTAAAGGTTGGAATAAAGAGGTTTTTGGCCATGTGGATGTGGATATTAATCAGCTTCAGATCGATTTGGAAAGGACTCAGAAACGTATCTTGGCTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780029.1
MERAAVKRMPFKFLNMWLVHQDFREFVKTSWHADISITCPLLKVMVKLKRLRSSLKGWNKEVFGHVDVDINQLQIDLERTQKRILAEGYSDALFDEEVELQARLSTRLLRKDLLLKQKSRIRWLNDGDRNTSFFHNSLKARRKQLHIPQLNIDGTDSFDQEEIVAHIVRYFSNLFADSAVNTVTPDDVRNLVNSSVSQVQNTHLTSIPMDGEIKAAVFDLGGDSAAGPDGFTGVFFQHCWEIIKADICLAVRTFFNRNYL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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