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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004191`

染色体: Chr08 坐标: 51311458-51314790 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004191`
名称	SmilChr08G004191
描述	ubiquitin-conjugating enzyme E2 28-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	51311458 - 51314790 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998924`
GeneID	`130998924`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998924`
原始查询	`SmilChr08G004191`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ubiquitin-conjugating enzyme E2 28-like
产物	ubiquitin-conjugating enzyme E2 28-like
Arabidopsis	`AT1G64230` (UBC28) ubiquitin-conjugating enzyme 28 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842728] identity=95.2; qcov=0.969; evalue=4.7e-89; confidence=high
Rice	`Os04g0667800` (Dhr6) - identity=95.2; qcov=0.969; evalue=6.61e-89; confidence=high
GO	GO:0000209 (protein polyubiquitination); GO:0005634 (nucleus); GO:0061631 (ubiquitin conjugating enzyme activity)
KEGG	smil03083 (Polycomb repressive complex - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04120 (Ubiquitin mediated proteolysis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00179 (UQ_con)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998924

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057780339.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057780339.1`
3	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057780339.1`
4	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057780339.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780339.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:51311758`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A7
`Chr8:51312527`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,B120
`Chr8:51314520`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780339.1

148 aa

148

UQ_con

PF00179 UQ_con 5-141 aa

XP_057780340.1

129 aa

129

UQ_con

PF00179 UQ_con 7-122 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780339.1`	Pfam	`PF00179`	UQ_con	Domain	5	141	3e-55	186.4	Ubiquitin-conjugating enzyme
`XP_057780340.1`	Pfam	`PF00179`	UQ_con	Domain	7	122	7.3e-50	168.9	Ubiquitin-conjugating enzyme

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924356.1
TATTGCACATTAAATTAATTTATTAATAGAAAATAATTAAAAAGTCGCACTATATTCTCCTTAGCGTCAAGAAGCAGCAGCGGCAGCTGAACCAGAAGAAATTAGGGGGAGAAAAAGTAAAAAACAACAAAAAAAAAGTCTCATTTCTTTCAAGGAATTCGATCGTTCGTATATATACGCAACCTCATTTTTATCCGTGGGCTTCATTTTTTGCCCTTGAATTCAATTTGGCAGATCTGATTCATGAACGATGGCTTCCA...

XM_057924357.1
TACAATTTTTTTTTGTTTTTATGTGGTCTATAGTTTGATCTTCGATTTGCGTGTTGGCTAGATGTGGCTAGATGGACCTGTTGGTGAAGACATGTTTCACTGGCAAGCCACTATAATGGGTCCACAAGATAGTCCTTATGCAGGAGGGGTGTTTTTAGTCACCATTCATTTCCCCCCTGATTACCCATTCAAACCTCCAAAGGTAGCATTCAGGACAAAAGTTTTTCACCCGAATATTAATAGCAATGGGAGCATTTGCC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130998924
ATGGCTTCCAAACGGATCTTGAAGGAGCTAAAGGATTTGCAGAAAGATCCTCCCACTTCCTGTAGCGCGGGACCTGTTGGTGAAGACATGTTTCACTGGCAAGCCACTATAATGGGTCCACAAGATAGTCCTTATGCAGGAGGGGTGTTTTTAGTCACCATTCATTTCCCCCCTGATTACCCATTCAAACCTCCAAAGGTAGCATTCAGGACAAAAGTTTTTCACCCGAATATTAATAGCAATGGGAGCATTTGCCTTGA...

LOC130998924
ATGTGGCTAGATGGACCTGTTGGTGAAGACATGTTTCACTGGCAAGCCACTATAATGGGTCCACAAGATAGTCCTTATGCAGGAGGGGTGTTTTTAGTCACCATTCATTTCCCCCCTGATTACCCATTCAAACCTCCAAAGGTAGCATTCAGGACAAAAGTTTTTCACCCGAATATTAATAGCAATGGGAGCATTTGCCTTGATATCTTGAAAGAACAGTGGAGCCCTGCCTTGACAATTTCCAAGGTGTTGCTCTCGAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057780339.1
MASKRILKELKDLQKDPPTSCSAGPVGEDMFHWQATIMGPQDSPYAGGVFLVTIHFPPDYPFKPPKVAFRTKVFHPNINSNGSICLDILKEQWSPALTISKVLLSICSLLTDPNPDDPLVPEIAHMYKTDRTKYEQTARSWTQKYAMG

XP_057780340.1
MWLDGPVGEDMFHWQATIMGPQDSPYAGGVFLVTIHFPPDYPFKPPKVAFRTKVFHPNINSNGSICLDILKEQWSPALTISKVLLSICSLLTDPNPDDPLVPEIAHMYKTDRTKYEQTARSWTQKYAMG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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