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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004197`

染色体: Chr08 坐标: 51368109-51370035 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004197`
名称	SmilChr08G004197
描述	GDSL esterase/lipase At4g01130-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	51368109 - 51370035 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998931`
GeneID	`130998931`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998931`
原始查询	`SmilChr08G004197`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GDSL esterase/lipase At4g01130-like
产物	GDSL esterase/lipase At4g01130-like
Arabidopsis	`AT4G01130` (AT4G01130) GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828207] identity=66.6; qcov=0.994; evalue=1.97e-158; confidence=high
Rice	`Os06g0160200` (OsGELP80) - identity=59.2; qcov=0.997; evalue=5.57e-148; confidence=high
GO	GO:0016788 (hydrolase activity, acting on ester bonds)
KEGG	-
Pfam	PF00657 (Lipase_GDSL)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998931

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057780347.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780347.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780347.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780347.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057780347.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:51369438`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr8:51369691`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	C33,C61
`Chr8:51369691`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	2	C33,C61
`Chr8:51369698`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	115	A11,A14,A18,A2,A23,A25,A3,A4,A5,A7,A8,B101,B104,B105,B107,B108,B110,B113,B117,B12,B121,B123,B124,B126,B130,B134,B136,B14,B140,B15,B17,B19,B2,B22,B24,B26,B27,B28,B3,B33,B34,B37,B4,B44,B45,B46,B47,B5,B53,B54,B55,B57,B62,B63,B69,B7,B70,B71,B74,B75,B76,B78,B8,B80,B83,B86,B88,B9,B90,B92,B97,B98,B99,C11,C14,C16,C18,C2,C25,C26,C27,C31,C32,C34,C36,C37,C40,C41,C44,C49,C5,C51,C55,C56,C57,C6,C62,C63,C65,C67,C68,C69,C7,C73,C77,C78,C79,C80,C81,C82,C83,C9,D1,D2,D3
`Chr8:51369902`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780347.1

322 aa

161

322

Lipase_GDSL

PF00657 Lipase_GDSL 3-300 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780347.1`	Pfam	`PF00657`	Lipase_GDSL	Family	3	300	9.5e-42	144.2	GDSL-like Lipase/Acylhydrolase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924364.1
CACAAACATATAAGCTCTATCCTTAAACTTTCTGAACTCACAAAACCACACAACACACACTGAAAGAGTTGAGTGACAGATTCAAGAATGAATCTTGAAATCAGTAGGCAAAAGTTGCTGGTTTTTGCAGCTGGTTGTGGCAATATTCAGCTGCAAGAATCCATGGTGAAAAATGTGGTTTTGAGGCTATCTTCAACTTCGGGGACTCGAACTCCGACACGGGAGGATTTTACGCTGCTTTCCCGGCGGAGAGGCTGCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998931
ATGACTTACTTCCACAAACCGGCCGGCCGAGCAACAGATGGCAGGGTTATTGTTGATTTTTTAGCACAAGCTCTGGGGATACCATTCTTGAGCCCATATCTGCAGTCAATTGGATCAGATTTCAGGCATGGTGCCAATTTTGCAACATTGGCATCGACAGTTCGTTTGCCGCAGACTTCATTGTTTGTCACAGGAGTTAGCCCTTTTTCTCTTGCTATTCAGCTCAATCAAATGAAGCAATTTAAGGCCAAAGTTGATCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780347.1
MTYFHKPAGRATDGRVIVDFLAQALGIPFLSPYLQSIGSDFRHGANFATLASTVRLPQTSLFVTGVSPFSLAIQLNQMKQFKAKVDQLHSSSAKLPPPTIFGKSLYTFYIGQNDFTGNLAYIGINGVKQYLPQVVSQIAGTIKEIYALGGRDFLVLNLAPIGCYPAFLVELPHNASDIDSFGCLIPYNNAVVDYNTMLEEALKQTRREIGDANVVYTDIHSVMLELFHHPTSHGMKYGTKACCGYGGGAYNFDQRVYCGN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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