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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004199`

染色体: Chr08 坐标: 51374926-51376917 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004199`
名称	SmilChr08G004199
描述	protein CURVATURE THYLAKOID 1A, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	51374926 - 51376917 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998932`
GeneID	`130998932`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998932`
原始查询	`SmilChr08G004199`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein CURVATURE THYLAKOID 1A, chloroplastic-like
产物	protein CURVATURE THYLAKOID 1A%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT4G01150` (AT4G01150) CURVATURE THYLAKOID 1A-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828181] identity=57.6; qcov=1.04; evalue=2.26e-58; confidence=high
Rice	`Os06g0264800` - identity=57.8; qcov=1.01; evalue=2.13e-52; confidence=high
GO	GO:0009535 (chloroplast thylakoid membrane); GO:0009579 (thylakoid)
KEGG	-
Pfam	PF14159 (CAAD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998932

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057780348.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057780348.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	1.00000	`XP_057780349.1`
4	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057780348.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780348.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:51375213`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:51376261`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:51376419`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B10,B41
`Chr8:51376451`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B33,B44,B49,C32,C68
`Chr8:51376581`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B13
`Chr8:51376581`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr8:51376646`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,B88,C73,C81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780348.1

179 aa

179

CAAD

PF14159 CAAD 74-115 aa

XP_057780349.1

167 aa

167

CAAD

PF14159 CAAD 74-138 aa

XP_057780350.1

159 aa

159

CAAD

PF14159 CAAD 74-157 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780348.1`	Pfam	`PF14159`	CAAD	Domain	74	115	1.3e-07	32.0	CAAD domains of cyanobacterial aminoacyl-tRNA synthetase
`XP_057780349.1`	Pfam	`PF14159`	CAAD	Domain	74	138	2.1e-24	85.9	CAAD domains of cyanobacterial aminoacyl-tRNA synthetase
`XP_057780350.1`	Pfam	`PF14159`	CAAD	Domain	74	157	3.4e-31	107.7	CAAD domains of cyanobacterial aminoacyl-tRNA synthetase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924367.1
TGATTTTGAAACAAAAAATACTAGATTATCAAGATAGGAAACCAACCAATCACAAAGCATCGATTATCCACGTGTCAGCCGGTAGAATCATCTTAACATTGACCCTGAAAATTGTTGTGGATATCAAAAAATTGTACTAAAAAAATTTATAATCTTTGGAGATAAAGAAAGAGAGGCTTAGCAGCAAAAGCTACATTTTTTGTTTCTTCGATTTGCAGAAATCACATTTCCTTGGGCTTCAGCCAAAAATGGCAGCGGCA...

XM_057924366.1
TGTGGATATCAAAAAATTGTACTAAAAAAATTTATAATCTTTGGAGATAAAGAAAGAGAGGCTTAGCAGCAAAAGCTACATTTTTTGTTTCTTCGATTTGCAGAAATCACATTTCCTTGGGCTTCAGCCAAAAATGGCAGCGGCAGCTTCCACTTCCATGGCGGCCACCGCCGTCTTGCTCCACCGCCTCCCCGCCGCCAGACCCGCCGCCGTCTTCTGCCCCTTGCCCCAACGCCCTACCCTTTCCGCCACTCCCTTCA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130998932
ATGGCAGCGGCAGCTTCCACTTCCATGGCGGCCACCGCCGTCTTGCTCCACCGCCTCCCCGCCGCCAGACCCGCCGCCGTCTTCTGCCCCTTGCCCCAACGCCCTACCCTTTCCGCCACTCCCTTCAAGCTGCTCAAAGAGTCGAGGAGGTCCTCCCAGCTCCTTGTCAAGGCCACTTCGTCAGAGGAGAGCTCTCTCGACACCACTGAATTGTTCAACGACCTCAAAGGAAAGTGGGATGCTGTTGAAAACAAAACTAC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057780348.1
MAAAASTSMAATAVLLHRLPAARPAAVFCPLPQRPTLSATPFKLLKESRRSSQLLVKATSSEESSLDTTELFNDLKGKWDAVENKTTVILYGGASIVAIWLASTVVGAVNSVPLVGFSSCSSLKPSVFLFVDIANEYSSSSASQDHGVGRAWIHRLVCVPLPALQGTPPKRSILICILW

XP_057780349.1
MAAAASTSMAATAVLLHRLPAARPAAVFCPLPQRPTLSATPFKLLKESRRSSQLLVKATSSEESSLDTTELFNDLKGKWDAVENKTTVILYGGASIVAIWLASTVVGAVNSVPLLPKIMELVGLGYTGWFVYRYLLFKVRPQNEAYLFVFSGKCCDLYLMCFILAVK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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