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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004200`

染色体: Chr08 坐标: 51376938-51379570 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004200`
名称	SmilChr08G004200
描述	eukaryotic translation initiation factor 1A
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	51376938 - 51379570 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998934`
GeneID	`130998934`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998934`
原始查询	`SmilChr08G004200`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	eukaryotic translation initiation factor 1A
产物	eukaryotic translation initiation factor 1A
Arabidopsis	`AT2G04520` (AT2G04520) Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814994] identity=88.3; qcov=1; evalue=6.02e-88; confidence=high
Rice	`Os06g0342200` (OseIF1A-2) - identity=85.6; qcov=1.01; evalue=4.75e-84; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0003743 (translation initiation factor activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006413 (translational initiation)
KEGG	-
Pfam	PF01176 (eIF-1a)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998934

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057780352.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057780352.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057780352.1`
4	Nucleolus	核仁	0.60000	`XP_057780352.1`
5	Nucleolar fibrillar center	Nucleolar fibrillar center	0.60000	`XP_057780352.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:51377121`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr8:51377281`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B106,B117,B37,C31,C81
`Chr8:51378256`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,C1,C18
`Chr8:51378286`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B76,C2
`Chr8:51378367`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,B49,C32,C68
`Chr8:51378373`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B1,C1,C18

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780352.1

145 aa

145

eIF-1a

PF01176 eIF-1a 23-116 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780352.1`	Pfam	`PF01176`	eIF-1a	Domain	23	116	7.2e-32	109.5	Translation initiation factor 1A / IF-1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924369.1
CTTTTGAGAATAAACCAAAGCTCTGAAATATAGTATCTCATGTCCAATATACATGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTACCAATAGAGAACTAAACCTATCTTAATGTAGACTTTATAGCTTAGAGTTTTCTTCACCTTAACAATAATGAGTGATGATTCAAAAAATCTTTAAAATAATACTCTCTCTCATTAGTAATGTCTCAATTACTATATTCGAACGTTTTATTAATAATGTCTTATACTGTTTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998934
ATGCCGAAGAACAAGGGTAAGGGAGGGAAGAATCGGAAGAGAGGTAAGAACGAAGCCGACGACGAGAAGAGAGAATTGGTCTTTAAGGAAGACGGACAGGAATACGCGCAGGTCATGCGCATGCTCGGGAACGGCCGCTGCGAGGCCACCTGCATCGATGGCGTCAAACGCCTCTGTCACATCCGTGGGAAGATGCACAAGAAGGTTTGGATCGCCGCCGGCGATATTATCCTCGTCGGTCTCCGCGATTATCAGGATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780352.1
MPKNKGKGGKNRKRGKNEADDEKRELVFKEDGQEYAQVMRMLGNGRCEATCIDGVKRLCHIRGKMHKKVWIAAGDIILVGLRDYQDDKADVILKYMPDEARLLKAYGELPENTRLNEGIAGGLDEEDDGPGDDYIEFEDEDIDKL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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