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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004203`

染色体: Chr08 坐标: 51386467-51389797 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004203`
名称	SmilChr08G004203
描述	uncharacterized protein At5g41620-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	51386467 - 51389797 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998936`
GeneID	`130998936`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998936`
原始查询	`SmilChr08G004203`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	intracellular protein transporter USO1-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834164]; symbol=AT5G41620; hit=AT5G41620; species=arabidopsis; confidence=low
产物	intracellular protein transporter USO1-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834164]; symbol=AT5G41620; hit=AT5G41620; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G41620` (AT5G41620) intracellular protein transporter USO1-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834164] identity=33.6; qcov=1.05; evalue=9e-76; confidence=low
Rice	`Os02g0260500` (SIP7) - identity=36.1; qcov=0.769; evalue=1.64e-72; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998936

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoskeleton	细胞骨架	0.80000	`XP_057780356.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057780356.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057780356.1`
4	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057780356.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780356.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:51386688`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:51386748`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:51386787`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D2
`Chr8:51386787`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D2
`Chr8:51386799`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B66,B8,C87
`Chr8:51386994`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr8:51387029`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr8:51387079`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr8:51387103`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C76
`Chr8:51387112`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:51387247`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B69,B73,C23,D11
`Chr8:51387252`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924373.1
AACCATAATAAGCATCAGGTGGCTAAGATTGCCACGTGTCGAGGTACGAAACATAGTATAAAACCCTCAGAAACCATTCTTCCCAAAAAGGGCTAAAATTGTCGTAGATTTTACCCTAATTTCATAAATGTTCCCCACAGATTACGTGCAACTGCAGATGCAGATGGCATCCATGGTTAGGATTAACCCTACTCTAAATCGCTTTATTCCTCCGTAGCCATCGCTTTTGAGGAACAAGGCATGCAAGCAAAGCGTTTCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998936
ATGGACAGGGAGGAAAAGGTAAAGGAAGGGGAGAGAAAAAGAGGTGAATTAATGGTGGAAAAGTTGAAGCGCGGGATTTTGGTAGGGAAAAGAGAGGGAAAATCGACTCCACCCCCGACTTGGAAATTCGGGTTAGTTCAAACTGATGGTACCCTAATTCCAGAATCCAACTTCTCCACAAATTTGAACACTCTCTCTGCTAGGAAATTGGGTGCCAATCTGTGGGAGATGGAACCCCAACTCAATCACAGGGTGGTTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780356.1
MDREEKVKEGERKRGELMVEKLKRGILVGKREGKSTPPPTWKFGLVQTDGTLIPESNFSTNLNTLSARKLGANLWEMEPQLNHRVVKINKNGPILSNQRLEDKSSGIPKELDEEAAPPLSPSKQEASGISFRKQLAASLALHSARVDKVGQAHRPLSPASCSSSMEMAPPHRSAVSPNSSVVSNGKFGESSYSLKTSTELLKVLNKIWSLEEKHALDMSLVRALKRELEQSQARNQELVQEKKRDQNEIDHLMKQMTEYK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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