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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004209`

染色体: Chr08 坐标: 51487855-51488273 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004209`
名称	SmilChr08G004209
描述	(-)-5-epieremophilene synthase STPS3-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	51487855 - 51488273 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998940`
GeneID	`130998940`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998940`
原始查询	`SmilChr08G004209`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	(-)-5-epieremophilene synthase STPS3-like
产物	(-)-5-epieremophilene synthase STPS3-like
Arabidopsis	`AT4G16740` (TPS03) terpene synthase 03 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827377] identity=38.8; qcov=0.885; evalue=5.01e-13; confidence=low
Rice	`Os07g0218200` (TPS3) - identity=37.8; qcov=0.771; evalue=1.34e-09; confidence=low
GO	GO:0010333 (terpene synthase activity)
KEGG	-
Pfam	PF01397 (Terpene_synth)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998940

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057780362.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057780362.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780362.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780362.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780362.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:51487913`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B140,B76,B96,C23,C55
`Chr8:51488075`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B45,C54,C7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780362.1

96 aa

Terpene_synth

PF01397 Terpene_synth 19-93 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780362.1`	Pfam	`PF01397`	Terpene_synth	Repeat	19	93	1.2e-16	61.7	Terpene synthase, N-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924379.1
CATTCAAGAATGGCTAAAACACAAGCAGAAATTCAGAGGCCCATCGCCAATTTCTCCCCAAGTTTGTGGGGCGATCAGTTCATCAAGGATGATTCTGGTGCTAAGGCTGCGGAGAAACATTGCAAGGCAGTTGAAGAGTTGAAGAAGGAAGTTATGAATATGATAACTGCTGCTGAAAGCAATCTTGTTGAAGCGATGAACCATATTGACACACTCGAACGCCTTGGCATTTCTTATCACTTTGAAAAGGAGATTGACCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998940
ATGGCTAAAACACAAGCAGAAATTCAGAGGCCCATCGCCAATTTCTCCCCAAGTTTGTGGGGCGATCAGTTCATCAAGGATGATTCTGGTGCTAAGGCTGCGGAGAAACATTGCAAGGCAGTTGAAGAGTTGAAGAAGGAAGTTATGAATATGATAACTGCTGCTGAAAGCAATCTTGTTGAAGCGATGAACCATATTGACACACTCGAACGCCTTGGCATTTCTTATCACTTTGAAAAGGAGATTGACCAAAAATTGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780362.1
MAKTQAEIQRPIANFSPSLWGDQFIKDDSGAKAAEKHCKAVEELKKEVMNMITAAESNLVEAMNHIDTLERLGISYHFEKEIDQKLNHFFNLNTDY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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