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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004212`

染色体: Chr08 坐标: 51511912-51512883 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004212`
名称	SmilChr08G004212
描述	wall-associated receptor kinase-like 17
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	51511912 - 51512883 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998639`
GeneID	`130998639`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998639`
原始查询	`SmilChr08G004212`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	wall-associated receptor kinase-like 17
产物	wall-associated receptor kinase-like 17
Arabidopsis	`AT4G31100` (AT4G31100) wall-associated kinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829237] identity=29.3; qcov=0.861; evalue=3.1e-15; confidence=low
Rice	`Os11g0690332` - identity=29.5; qcov=0.868; evalue=1.53e-18; confidence=low
GO	GO:0030247 (polysaccharide binding)
KEGG	-
Pfam	PF13947 (GUB_WAK_bind)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998639

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057780036.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780036.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780036.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780036.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057780036.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:51512047`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	45	A15,A19,A20,A7,B1,B101,B107,B110,B112,B113,B121,B122,B124,B14,B27,B3,B4,B5,B51,B52,B62,B69,B73,B75,B86,B9,B91,B93,B94,B98,C10,C13,C16,C22,C23,C26,C4,C5,C56,C78,C80,C82,D1,D10,D2
`Chr8:51512112`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C18
`Chr8:51512112`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C18
`Chr8:51512282`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr8:51512303`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:51512332`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B123,B14
`Chr8:51512349`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,B49,C32,C68
`Chr8:51512451`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr8:51512486`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:51512495`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	17	A1,A20,A25,B122,B133,B25,B34,B40,B50,B65,C11,C17,C59,C69,C74,C76,D8
`Chr8:51512522`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	C32,C68
`Chr8:51512522`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	2	C32,C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780036.1

281 aa

140

281

GUB_WAK_bind

PF13947 GUB_WAK_bind 57-114 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780036.1`	Pfam	`PF13947`	GUB_WAK_bind	Domain	57	114	1.4e-09	38.9	Wall-associated receptor kinase galacturonan-binding

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924053.1
TTTCTCATCAAATATTTCAATATTTTCACAAAATTTACAATGATATTTTAAGCACGAGTATGAAAAGAATTCCAAAGAGATAATTATTTTTGTCTACAAAATCATACAAGTTCTCACATAATTCTTTTCATGACTCCAACACATCTCTTGATCATCAACAGAAATTTGCAGACTTCATATATACATGTATATTTTTGGAAGAAAAAGATGAATCCGCCATTAATACTCATCATCATCAACACCTTACTATGCCTAACACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998639
ATGACTCCAACACATCTCTTGATCATCAACAGAAATTTGCAGACTTCATATATACATGTATATTTTTGGAAGAAAAAGATGAATCCGCCATTAATACTCATCATCATCAACACCTTACTATGCCTAACACCAACCACAGCTGCAGAAGCATCGCTCTCCAAAAATGGGTGCCAACAAAAATGCGGAGACGTAACCATCCCTTACCCCTTCGGCATCGGCCCCAACTGCAGCTTCAACACCTCGTACGCAGTCGAATGCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780036.1
MTPTHLLIINRNLQTSYIHVYFWKKKMNPPLILIIINTLLCLTPTTAAEASLSKNGCQQKCGDVTIPYPFGIGPNCSFNTSYAVECGSQSKPFLKSTGLEAFDFSLSDNTVRVMQRVTPLNCSSKSGQFQLGQSLLGSPFTLGASINRAVVVGCRSEVSLVGPASAASSGGCRPTCGAAAAAGCFGINCCSVIVPEMSQRVEAAYAVTQDGGGGDDSVCGYAFLADYKWLSREYEDYVNFSTPAAEMTALRWVPATLEWR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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