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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004218`

染色体: Chr08 坐标: 51570205-51572375 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004218`
名称	SmilChr08G004218
描述	uncharacterized SmilChr08G004218
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	51570205 - 51572375 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998951`
GeneID	`130998951`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998951`
原始查询	`SmilChr08G004218`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DUF2358 family protein (DUF2358) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819229]; symbol=AT2G46220; hit=AT2G46220; species=arabidopsis; confidence=high
产物	DUF2358 family protein (DUF2358) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819229]; symbol=AT2G46220; hit=AT2G46220; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G46220` (AT2G46220) DUF2358 family protein (DUF2358) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819229] identity=57; qcov=0.893; evalue=2.06e-92; confidence=high
Rice	`Os05g0215600` - identity=48.8; qcov=1.05; evalue=3.13e-85; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF10184 (DUF2358); PF12680 (SnoaL_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998951

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057780377.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057780377.1`
3	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.40000	`XP_057780377.1`
4	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.40000	`XP_057780377.1`
5	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.20000	`XP_057780377.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:51570463`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr8:51570539`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:51571702`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780377.1

281 aa

140

281

DUF2358

SnoaL_2

PF10184 DUF2358 98-208 aa PF12680 SnoaL_2 117-208 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780377.1`	Pfam	`PF10184`	DUF2358	Domain	98	208	3.6e-40	137.4	Uncharacterized conserved protein (DUF2358)
`XP_057780377.1`	Pfam	`PF12680`	SnoaL_2	Domain	117	208	1.3e-07	32.8	SnoaL-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924394.1
TATTAGATTTCGGATTATCCAAAAACACAAGACCTATCCAATCATTCTTCATCTTCATTTTCCAGCAATGATTTTCCAACTATTTCCTTTGCAATCAAACAAAATTCTCTCTCTCGTATATTCGCATCGCAGAAATATTGAACGCCAAATGTCAATTTCAAACCAAACTTAGATTGGAAAAAGTTAGAAATCTTTTTTAGTCTCAACTATCAAAATTCCCCCAAATTCGAGGTATGGCGTTCTCGATTCACTCGCCGGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998951
ATGGCGTTCTCGATTCACTCGCCGGGAATTTCATTGCTCGCCGGAAGTGGAAGGCCTGGGAGAATCACTCCGGCAACCAGAAGAAGAAACGTCAGGTTTTCCGTCTGTTCGGGCGTTAAGGATTTGGAGAAGAAGAAGGTTTCGAAATTGAGGAGAGGCGGCGATGGATACGAGGATAGTCTGTGGTGGTTGTACGGGCAGGTGAAGCAGGAGGAGACGGTGTCGTTTTCCGTGAGCGAGGTTAAGGATGAGGAAGGGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780377.1
MAFSIHSPGISLLAGSGRPGRITPATRRRNVRFSVCSGVKDLEKKKVSKLRRGGDGYEDSLWWLYGQVKQEETVSFSVSEVKDEEGKKQDYYVNTGYAIRTIREEFPELFYRELSFDIYRDDIVFKDPLNTFYGIENYKSIFWALRFHGRIFFKALWVDIVSVWQPVENLIMVRWTVHGIPRVPWESHSRFDGTSEYKLDKDGKIYEHKVHNIALNGPQKFQVIGVELLIQSIGCPSTPKPTYFELLSPSTTNIVPLMKL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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