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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004219`

染色体: Chr08 坐标: 51575696-51577517 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004219`
名称	SmilChr08G004219
描述	delta(8)-fatty-acid desaturase-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	51575696 - 51577517 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998952`
GeneID	`130998952`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998952`
原始查询	`SmilChr08G004219`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	delta(8)-fatty-acid desaturase-like
产物	delta(8)-fatty-acid desaturase-like
Arabidopsis	`AT2G46210` (SLD2) Fatty acid/sphingolipid desaturase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819228] identity=68.2; qcov=0.985; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0338500` - identity=57.3; qcov=0.993; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0006629 (lipid metabolic process); GO:0016020 (membrane); GO:0016717 (oxidoreductase activity, acting on paired donors, with oxidation of a pair of donors resulting in the reduction of molecular oxygen to two molecules of water)
KEGG	-
Pfam	PF00173 (Cyt-b5); PF00487 (FA_desaturase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998952

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057780378.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057780378.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780378.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780378.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780378.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:51576218`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B105,B84,C3,D1
`Chr8:51576218`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B105,B84,C3,D1
`Chr8:51576248`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B19,B22,C9
`Chr8:51576341`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr8:51576437`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr8:51576610`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B119,B41,B71,B89,C70
`Chr8:51576614`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,B50,C82
`Chr8:51576852`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A19
`Chr8:51576852`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A19
`Chr8:51576872`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr8:51576875`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19
`Chr8:51576878`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780378.1

453 aa

226

453

Cyt-b5

FA_desaturase

PF00173 Cyt-b5 13-82 aa PF00487 FA_desaturase 141-412 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780378.1`	Pfam	`PF00173`	Cyt-b5	Domain	13	82	3.1e-23	82.3	Cytochrome b5-like Heme/Steroid binding domain
`XP_057780378.1`	Pfam	`PF00487`	FA_desaturase	Domain	141	412	1e-31	111.4	Fatty acid desaturase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924395.1
ACTGTAGTACCTGTCGTCCATTTCTTTTTCTTTATTCTTTTGTTAGCGGAAGTCGCCCATTTACATATGTAGTCCACCGCTTTAAACGGCAACGGAGAAAAACTATCACAAAATATCCCACACGTTTAAAGACTCCTATAATTCAAACTAGAGCGAGACAGAGACACACTGAGACAGAGAGGGGAGAGGAAAGGAGAGAGAGCAAAGCAGAGCACCATAAAACCACCTCTCCAACCTCTCCCATTTCCATAAAAAAAATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998952
ATGGCGGAAGACGGCGGGATGAAGAAGAAGCTGATCACCTCCGACGAGCTGAAGAAGCACAACAAGCCCGACGACCTCTGGCTCTCGATCCAAGGCAAGGTCTACGACGTCACCGATTGGGCTAAAACCCACCCCGGCGGCGCCACCCCCCTCCTCAACCTCGCCGGCAACGACGTCACCGACGCCTTCATCGCCTTCCACCCGGCCTCCGCCTGGCGCCACCTCGACCGCTTCTCCACCGGCTACCACCTCGCCGACTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780378.1
MAEDGGMKKKLITSDELKKHNKPDDLWLSIQGKVYDVTDWAKTHPGGATPLLNLAGNDVTDAFIAFHPASAWRHLDRFSTGYHLADSHVSAVSKDYRNLAAAFARSGLFDDKGHGVLLSLLSISAILSAVVCGVLRSDSPLVHALSGALLGLAWMLIAYLGHDSGHYNIMPNSSLNKVAQILTGNCLTGISIAWWKWTHNAHHVACNSLDYDPDLQHLPMLAVSSKLFHSLTSRFYDRRLTFDSLSRFFVSYQHFTFYPV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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