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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004220`

染色体: Chr08 坐标: 51602779-51603549 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004220`
名称	SmilChr08G004220
描述	uncharacterized SmilChr08G004220
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	51602779 - 51603549 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998640`
GeneID	`130998640`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998640`
原始查询	`SmilChr08G004220`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01107 (MP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998640

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057780038.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057780038.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057780038.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780038.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780038.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:51602786`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	90	A1,A13,A14,A15,A25,B103,B105,B107,B11,B110,B111,B115,B118,B119,B12,B127,B131,B133,B134,B137,B138,B18,B20,B21,B23,B27,B28,B31,B33,B34,B35,B40,B42,B43,B47,B49,B55,B56,B59,B64,B68,B72,B75,B79,B81,B84,B86,B87,B88,B90,B92,B93,B94,B96,B99,C15,C17,C21,C28,C3,C30,C33,C37,C38,C43,C45,C5,C50,C53,C54,C58,C61,C62,C64,C66,C67,C7,C72,C75,C77,C82,C84,C85,C86,C87,C9,D1,D3,D7,D9
`Chr8:51602797`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B24,B28,C28,C37
`Chr8:51602817`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B24,B28,C28,C37
`Chr8:51602829`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B24,B28,C28,C37
`Chr8:51602837`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:51602841`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,C28
`Chr8:51602842`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,C28
`Chr8:51602897`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C82
`Chr8:51602897`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C82
`Chr8:51602917`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B138,C44
`Chr8:51602934`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr8:51602964`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780038.1

256 aa

128

256

PF01107 MP 1-110 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780038.1`	Pfam	`PF01107`	MP	Family	1	110	9.6e-23	81.5	Viral movement protein (MP)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924055.1
ATGAAATGGATTCATATTGGAGCAATCCAATTGGTAATCAAGTCTGGACTCAAACGAGGGACGGATACACCAATTGATGTTGCACTTTGTGACAAGAGGGTCATAAATACGAAAGATTCAGTACTGGGAACCTTCTCAGGCAATCTCTACGCCAAGAAGATTATAACTGAATTATATCCACAGATCGCTTATAATCTTCAAGATTCATCCTTCAGTCGAGCCCTGACACTCAACCAGGACTACAAGAGGAAGGATCTATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998640
ATGAAATGGATTCATATTGGAGCAATCCAATTGGTAATCAAGTCTGGACTCAAACGAGGGACGGATACACCAATTGATGTTGCACTTTGTGACAAGAGGGTCATAAATACGAAAGATTCAGTACTGGGAACCTTCTCAGGCAATCTCTACGCCAAGAAGATTATAACTGAATTATATCCACAGATCGCTTATAATCTTCAAGATTCATCCTTCAGTCGAGCCCTGACACTCAACCAGGACTACAAGAGGAAGGATCTATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780038.1
MKWIHIGAIQLVIKSGLKRGTDTPIDVALCDKRVINTKDSVLGTFSGNLYAKKIITELYPQIAYNLQDSSFSRALTLNQDYKRKDLLTEGNRPYSITYQVSYALSNSHHTDLFLGKNFIEVPEIFKEVAKAVSLDRVEISIIREIDIQVGAPRLSFQGDRLTSRPLETSLSHSYERRAIQETSALGIRVKLKCPEGWINVSTEIDTTERKNQFPCNTLYYLDNPESNRYIGILEIGGFEIKIEGKAGQEADVLILG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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