当前解析结果
SmilChr08G004223| 统一新 Gene ID | SmilChr08G004223 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G004223 |
| 描述 | probable membrane-associated kinase regulator 6 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 51644273 - 51645622 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130998954 |
|---|---|
| GeneID | 130998954 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130998954 |
| 原始查询 | SmilChr08G004223 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | probable membrane-associated kinase regulator 6 |
| 产物 | probable membrane-associated kinase regulator 6 |
| Arabidopsis | AT5G52900 (MAKR6)membrane-associated kinase regulator [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835367] identity=31.6; qcov=1.14; evalue=2.95e-13; confidence=low |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF30942 (MAKR6) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130998954 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.80000 | XP_057780380.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057780380.1 |
| 3 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057780380.1 |
| 4 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057780380.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057780380.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:51644739 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B115 |
Chr8:51644804 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B107,B130,D11 |
Chr8:51644907 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C82 |
Chr8:51644995 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C41 |
Chr8:51645033 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B140,B2,B7,C48,C78 |
Chr8:51645049 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057780380.1PF30942
MAKR6 1-173 aa
PF30942
MAKR6 170-214 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057780380.1 |
Pfam | PF30942 |
MAKR6 | Family | 1 | 173 | 1.3e-42 | 147.2 | Membrane-associated kinase regulator 6 |
XP_057780380.1 |
Pfam | PF30942 |
MAKR6 | Family | 170 | 214 | 1.3e-42 | 147.2 | Membrane-associated kinase regulator 6 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。