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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004233`

染色体: Chr08 坐标: 51736758-51737961 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004233`
名称	SmilChr08G004233
描述	uncharacterized SmilChr08G004233
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	51736758 - 51737961 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998645`
GeneID	`130998645`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998645`
原始查询	`SmilChr08G004233`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G02650` (AT2G02650) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814794] identity=31.2; qcov=0.468; evalue=4.94e-12; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=30.7; qcov=0.671; evalue=2.26e-18; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998645

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057780042.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057780042.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057780042.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780042.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780042.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:51736766`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	58	A13,A14,A2,A21,A22,A25,A7,A8,B102,B105,B119,B123,B128,B132,B137,B15,B2,B21,B23,B26,B3,B38,B50,B53,B56,B57,B59,B61,B68,B72,B76,B84,B94,B98,B99,C21,C24,C29,C3,C42,C43,C45,C46,C47,C48,C51,C54,C59,C60,C69,C71,C73,C74,C79,C82,C86,C9,D11
`Chr8:51736800`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr8:51736807`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C33,D5
`Chr8:51736810`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,C71
`Chr8:51736823`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,C3,C47,C60,C82
`Chr8:51736831`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33
`Chr8:51736838`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,C21,C73
`Chr8:51736865`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,A8,B98
`Chr8:51736871`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B26
`Chr8:51736871`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr8:51736886`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,C21,C73
`Chr8:51736898`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,A8,B98

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780042.1

301 aa

150

301

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 32-126 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780042.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	32	126	2.7e-19	70.3	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924059.1
ATGACTAATGATCTGGTGGCTGCTATCTCCTCTGTTACTTTGAACGCAGGTACTGAAGACTATTGGCGTTGGAAGGCTACAAAAGAGGGCTCATTCTCTTCTAAGTCAGCTTATGGTTTAATCAAAAGCTCAAGGATCCCGGGTTCACAAGTGAGCTTAGACAAAGAGACGATGGAACAAGTGTGGGACACACCGGCCCCACAGAAAGCAAGATTAGTCACCTGGAGAATCCTGAGGAAAAGACTCCCAACGTGCGACAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998645
ATGACTAATGATCTGGTGGCTGCTATCTCCTCTGTTACTTTGAACGCAGGTACTGAAGACTATTGGCGTTGGAAGGCTACAAAAGAGGGCTCATTCTCTTCTAAGTCAGCTTATGGTTTAATCAAAAGCTCAAGGATCCCGGGTTCACAAGTGAGCTTAGACAAAGAGACGATGGAACAAGTGTGGGACACACCGGCCCCACAGAAAGCAAGATTAGTCACCTGGAGAATCCTGAGGAAAAGACTCCCAACGTGCGACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780042.1
MTNDLVAAISSVTLNAGTEDYWRWKATKEGSFSSKSAYGLIKSSRIPGSQVSLDKETMEQVWDTPAPQKARLVTWRILRKRLPTCDNLRRRNIHLGEEESMCNACCHKAETINHLFLECPKTTALWNGILNWLGINGPWPSDVEEHFKAFVNMGKSKSRKFLAALWMCVIWILWKSRNDSRFEGKPWDIQSVLRDIKVRLWSWNKIFNLSNHELSFSAWMTEKMARGSSDGHSGRRGRGDGRGRSSSTGASSQASDGGIR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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