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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004234`

染色体: Chr08 坐标: 51739731-51741444 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004234`
名称	SmilChr08G004234
描述	probable methyltransferase At1g29790
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	51739731 - 51741444 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998962`
GeneID	`130998962`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998962`
原始查询	`SmilChr08G004234`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable methyltransferase At1g29790
产物	probable methyltransferase At1g29790
Arabidopsis	`AT4G01240` (AT4G01240) S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827909] identity=59.8; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0474300` - identity=55; qcov=0.706; evalue=1.8e-130; confidence=high
GO	GO:0008168 (methyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF03141 (Methyltransf_29)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998962

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057780388.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780388.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780388.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780388.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057780388.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:51739833`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	69	A18,A21,A25,A7,B10,B101,B102,B103,B108,B119,B122,B125,B126,B128,B131,B135,B15,B19,B20,B22,B23,B24,B25,B37,B38,B39,B41,B46,B5,B51,B52,B54,B56,B58,B59,B61,B66,B71,B76,B77,B81,B82,B89,B96,C1,C12,C13,C19,C2,C24,C25,C27,C31,C35,C36,C41,C53,C55,C6,C70,C74,C75,C85,D2,D3,D4,D5,D6,D8
`Chr8:51739841`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B26
`Chr8:51739841`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B26
`Chr8:51739873`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B120,B136,C44,C75,D9
`Chr8:51740042`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	A15
`Chr8:51740042`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	A15
`Chr8:51740140`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr8:51740326`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:51740388`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B120,B136,B97,C75,D9
`Chr8:51740680`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B39
`Chr8:51740683`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr8:51740701`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780388.1

453 aa

226

453

Methyltransf_29

PF03141 Methyltransf_29 292-400 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780388.1`	Pfam	`PF03141`	Methyltransf_29	Family	292	400	1.2e-06	28.2	Putative S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924405.1
ATTTAGCTAGTGGTAATAATTAATTAAACAGAAGAAGTAGACTACTTTACTATCAGTATTACTTCATATCTACTTCGCAATGACTAATCTCAAGATTTTTATTATCACTACTCATTTTTTTTATCAACTTCCTTCATTCACACTCTCATTATTCCCCTATTCCTTAGTTAACACTTGATAATTCTTTCCACAAATTTAACTTTCTGTGACCATATCAACATATCATGCTTTTCTTGATCTCTCATACAAATCAACATGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998962
ATGGCTCTAAAAAGATTCAAATCAATGAACAAACTCATCATCTACTTATCAATCCTGGCCGCCGCAGTCTGCATCGCCACCTTCTCCAAAGCCTACTCCCTCAAATCCTTCCTCCGCTCCGACGCCTCGTGCAACCACGCCACCGCCGCCGCCTTCTTCCCGTCCCACGTCAACGAGCAAGAGATCAAGGAAACGCTCGACCTAGTCATCCACAAGCTCAAGCACGAGCTCGACAACATGCGCGCGGGAGCCATGCCCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780388.1
MALKRFKSMNKLIIYLSILAAAVCIATFSKAYSLKSFLRSDASCNHATAAAFFPSHVNEQEIKETLDLVIHKLKHELDNMRAGAMPPRSTHAPLLADVLGLIESAHASLSLGEGEEANQQARTKNLFAPAEHFLTEEIRKYIRVKPNRLGKQNFMGANGTHTSVGHGCFAARAELESYMDYDVGDVCNDDWKLAQKLMILGCDPLPRRRCFSRAPQLYAAPRPINESLWKLPEDRNVRWSGYRCKNFTCLASNATKKGFF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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